Le Kremlin de Rostov servait initialement de résidence au métropolite de l'éparchie de Rostov et était appelé la cour métropolitaine. Il est situé au centre de Rostov, près du lac Nero. Aujourd'hui, l'ensemble du Kremlin comprend la cour archiépiscopale, la place du Dôme avec la cathédrale de l'Assomption au nord et le jardin métropolitain au sud.

Lorsque le Kremlin a été construit, Rostov n'avait déjà plus d'importance défensive, donc ses structures défensives ont été simplifiées. Par exemple, il a de larges portes d'entrée, il n'y a pas de meurtrières dans les tours, et les fenêtres avec encadrements suivent la ligne du parapet supérieur. Malgré cela, le Kremlin a été érigé dans les traditions de la construction défensive russe antérieure et est un monument de l'architecture militaire pré-pétrovienne.

Depuis 1998, le Kremlin de Rostov prétend à l'inscription sur la liste du patrimoine mondial de l'UNESCO. Sa construction a commencé dans les années 1650 et s'est poursuivie jusqu'aux années 1680 selon le projet du métropolite Ionas Sisoïevitch, qui cherchait à créer un jardin paradisiaque, entouré de murs avec des tours et un étang au centre.

À Rostov, la réforme ecclésiastique a rencontré de la résistance, et de nombreux habitants ont maintenu leur foi ancienne même aux XVIIIe et XIXe siècles. En 1665, il a été ordonné à Ionas Sisoïevitch de rester en permanence à Rostov, et il a dirigé toute son énergie vers le renforcement de la grandeur de l'Église et de l'éparchie de Rostov.

La place du Dôme est apparue à la fin du Xe siècle après la construction de la première cathédrale de l'Assomption. La cathédrale actuelle, érigée entre 1508 et 1512, est le plus ancien bâtiment de la ville et impressionne par sa grandeur. La cloche de Rostov est célèbre pour ses cloches, la plus grande d'entre elles, Sisoï, pesant 32 tonnes.

La partie centrale de l'ensemble, la cour archiépiscopale, se trouve à l'emplacement de l'ancienne cour épiscopale, existant depuis le XIe siècle. Le métropolite Ion III Sisoïevitch a créé un ensemble unique, comprenant des églises domestiques, des palais et des bâtiments de service. Son activité est devenue un phénomène exceptionnel de la culture artistique russe de la seconde moitié du XVIIe siècle.

Dans les années 1650-1660, un bâtiment à deux étages du Tribunal a été construit, qui remplissait des fonctions judiciaires et gérait la métropole de Rostov. Vers 1670, une église de la Résurrection du Seigneur a été érigée à proximité, ornant l'entrée principale de la cour archiépiscopale. En face se dresse le bâtiment des appartements métropolitains, où vivaient les métropolites et où était conservé le trésor.

Vers 1675, un complexe de l'église de l'Image Non-Faite de la main a été construit. Au rez-de-chaussée se trouvaient des services de gestion, et à l'étage supérieur, l'église et la salle à manger. Au cours des années 1670-1680, les murs et les tours de la résidence métropolitaine ont été construits, qui, bien qu'ils n'aient pas eu de valeur défensive, démontraient la grandeur de l'éparchie.

L'un des derniers bâtiments était l'église de la porte de Saint Jean l'Évangéliste, et dans les années 1680, l'église de Saint Grégoire l'Évangéliste a été construite. Après la mort du métropolite Ion, une église de l'icône de la Mère de Dieu de l'Odigitrie a été érigée dans le Kremlin, complétant la formation de l'ensemble de la cour archiépiscopale.

Le métropolite Ion a accordé une grande attention à la peinture monumentale, et les fresques dans les églises du Kremlin ont été créées immédiatement après leur construction. Après le transfert du siège archiépiscopal à Yaroslavl en 1787, la cour métropolitaine a perdu son importance et s'est progressivement détériorée. Cependant, dans les années 1860 et 1880, le complexe a été restauré grâce aux fonds des marchands de Rostov.

En 1883, le musée des antiquités ecclésiastiques de Rostov a été ouvert dans le Kremlin. En 1910, la Douma d'État a confirmé son statut national. En 1953, une tornade a endommagé de nombreux monuments de l'ensemble, mais les travaux de restauration sous la direction de V.S. Banige ont restauré l'apparence initiale du Kremlin.

Depuis la fin des années 1960, le Kremlin de Rostov est devenu l'une des attractions clés de l'Anneau d'Or de Russie. En 1991, la cathédrale de l'Assomption a été transférée à l'Église orthodoxe russe. En 2010, le transfert de l'ensemble au sein de l'Église a été discuté, mais le projet n'a pas été réalisé. En 2013, le Kremlin de Rostov a été inclus dans le top dix des « Symboles de la Russie ».