Dans l'exposition du département, plus de trente collections privées, données depuis les années 1980, sont présentées. Actuellement, la collection du musée comprend plus de sept mille œuvres d'art russe et d'art occidental des XVe et XXe siècles. Il s'agit de peinture, de graphisme, de sculpture, d'art appliqué et de photographie artistique. Les collections varient en termes de direction et de structure, se divisent par types d'art et incluent des collections monographiques et thématiques.

Dans les grands musées du monde, les collections privées sont généralement dissoutes, et les œuvres sont réparties dans différents fonds. Seules les meilleures œuvres sont sélectionnées pour l'exposition, ce qui nuit à l'intégrité de la collection et fait perdre son unicité. La personnalité du collectionneur devient intéressante principalement pour les spécialistes.

L'exposition des salles du Département des collections personnelles préserve l'intégrité des collections individuelles et souligne l'intention initiale de leurs créateurs. Une attention particulière est accordée à la personnalité de chaque collectionneur, à ses goûts et à ses préférences. Selon le prince Serge Chcherbatov, l'un des premiers auteurs de l'idée de créer un musée des collections personnelles en Russie, un tel musée doit préserver le « lien spirituel » entre la collection et son propriétaire.

Une place particulière dans la collection est occupée par celle du fondateur du musée, le célèbre scientifique et acteur culturel du XXe siècle I. S. Zilberstein. Elle comprend plus de deux mille œuvres de peinture et de graphisme et occupe quatre salles de l'exposition. Ce sont des œuvres de haut niveau, réalisées dans diverses techniques et genres, représentant le travail de maîtres individuels et d'associations artistiques telles que « Le Monde de l'Art ». De telles collections pourraient constituer des musées à part entière.

De nombreuses collections sont précieuses grâce à la préservation de l'intention initiale du collectionneur et à leur haute qualité artistique. Parmi elles, la collection de peinture réaliste russe de la seconde moitié du XIXe et du début du XXe siècle de S. V. Soloviev, inspirée par l'activité de P. M. Tretiakov ; la collection de peinture russe de la fin du XIXe et du début du XXe siècle du professeur A. N. Ramm de Léningrad ; la collection de sculptures animalières en bronze du XIXe siècle du colonel des services vétérinaires E. S. Stepanov.

Le musée fait également découvrir aux visiteurs des collections rassemblées par des représentants de l'intelligentsia artistique et scientifique russe tout au long de leur vie. Elles comprennent non seulement des œuvres d'art, mais aussi des objets mémoriels révélant la personnalité du collectionneur. Le thème de l'environnement artistique de la personnalité créative est présenté dans une salle avec des œuvres picturales et graphiques de la collection du grand musicien et pianiste Sviatoslav Richter. Il était ami avec le GMI et inspirateur du festival musical « Soirées de décembre », qui se tient chaque année au musée. Sviatoslav Teofilovich a offert au Département des collections personnelles une collection d'œuvres de peinture et de graphisme de R. Falk, V. Shukhaev, N. Goncharova, D. Krasnopevcev et d'autres artistes.