Le monastère a reçu son nom de la région où il a été fondé, autrefois connue sous le nom de "montagne", et de la cathédrale de l'Assomption de la Mère de Dieu. La fondation du monastère date de 1590, lorsque la vieille moniale Domnikia, sous le règne du tsar Fiodor Ioannovitch et de l'archevêque de Vologda et de Velikoperm, Ion, est devenue sa première abbesse. Cela est confirmé par deux lettres conservées, dont l'une, une pétition de 1613, a été soumise par les moniales à l'archevêque Silvestre.

Le premier bâtiment en pierre du monastère, un corps de bâtiment hospitalier d'un étage, a été construit dans la seconde moitié du XVIIe siècle. En 1692 et 1699, la cathédrale de l'Assomption de la Mère de Dieu avec un clocher et une église d'hiver de saint Serge de Radonège a été érigée. En 1709 et 1714, l'église de la porte d'Alexis, homme de Dieu, a été construite. À la fin des années 1790, le monastère a été entouré d'une clôture en pierre avec quatre tours aux coins.

En 1792, un incendie a détruit tous les bâtiments en bois du monastère, ce qui a entraîné la perte de nombreux documents, et par conséquent, peu d'informations sur son histoire jusqu'au XIXe siècle ont été conservées. En 1824, l'empereur Alexandre Ier a visité le monastère, et en 1826 et 1828, grâce à ses fonds, un bâtiment d'abbesse à deux étages a été construit.

En 1860, par décret du Saint-Synode, l'église de Nikolaïevskaya Ozerskaya a été rattachée au monastère de Gorni-Uspensky. En 1870 et dans les années 1890, des bâtiments pour un orphelinat et une école de filles diocésaine ont été construits. Jusqu'à la fin du XIXe siècle, le monastère a servi de lieu d'exil pour les femmes pour adultère et prostitution. En 1880, le clocher a été reconstruit, et en 1888, l'évêque Théodose a transformé l'orphelinat en école de filles diocésaine, qui a déménagé dans un nouveau bâtiment en dehors du monastère en 1903.

En 1918, le monastère a été fermé, mais certaines moniales y sont restées jusqu'en 1923-1924, jusqu'à ce qu'il soit définitivement attribué aux besoins de l'Armée rouge. La cathédrale de l'Assomption est restée en activité jusqu'en 1924. Après l'expulsion, certaines moniales se sont installées dans des maisons près du monastère. Pendant la période soviétique, le territoire du monastère a abrité une prison de transit du NKVD et une unité militaire, et la clôture du monastère a été détruite.

En 1995, la restauration de l'église de l'Assomption a commencé, et depuis 1996, des services y ont été repris. La maison de l'abbé et le bâtiment de l'orphelinat ont été utilisés comme magasins et entrepôts. Le 15 novembre 2014, le métropolite de Vologda et de Kirillov, Ignace, a inspecté le bâtiment de l'abbesse et a décidé de former le monastère de Gorni-Uspensky en tant que dépendance archiépiscopale. En un an, l'ancien bâtiment de l'abbesse a été préparé pour le logement des sœurs et l'installation du département de chant de la séminaire spirituelle de Vologda. Le 24 décembre 2015, le Saint-Synode de l'Église orthodoxe russe a décidé d'ouvrir le monastère et de nommer la moniale Philaret Dorokhina comme abbesse. Le 26 décembre, le métropolite Ignace l'a élevée au rang d'abbesse.

Après la renaissance du monastère, des réparations majeures ont été effectuées dans plusieurs locaux, une partie de la toiture du bâtiment ancien a été remplacée, une exploitation agricole monastique a été créée, et la peinture d'icônes ainsi que la couture se développent.