El monasterio recibió su nombre de la localidad donde fue fundado, anteriormente conocida como "montaña", y de la catedral de la Asunción de la Madre de Dios. La fundación del monasterio data de 1590, cuando la anciana Domnikia, durante el reinado del zar Fiódor Ioánnovich y del arzobispo de Vologda y Gran Perm, Ionas, se convirtió en su primera abadesa. Esto se confirma con dos documentos que han sobrevivido, uno de los cuales es una petición de 1613 presentada por las ancianas al arzobispo Silvestre.

El primer edificio de piedra del monasterio, un cuerpo hospitalario de una planta, fue construido en la segunda mitad del siglo XVII. En 1692 y 1699 se erigió la catedral de la Asunción de la Madre de Dios con un campanario y una iglesia de invierno del venerable Sergio de Radonezh. En 1709 y 1714 se construyó la iglesia de la puerta de San Alexis, hombre de Dios. A finales de la década de 1790, el monasterio fue rodeado por un muro de piedra con cuatro torres en las esquinas.

En 1792, un incendio destruyó todos los edificios de madera del monasterio, lo que llevó a la pérdida de muchos documentos, y por lo tanto, hay pocos datos sobre su historia hasta el siglo XIX. En 1824, el emperador Alejandro I visitó el monasterio, y en 1826 y 1828, con sus fondos, se construyó un cuerpo abacial de dos plantas.

En 1860, por orden del Santo Sínodo, la iglesia de San Nicolás de Ozersk fue anexada al monasterio de Gorni-Uspenski. En 1870 y en la década de 1890 se construyeron edificios para un orfanato y una escuela femenina diocesana. Hasta finales del siglo XIX, el monasterio sirvió como lugar de exilio para mujeres por adulterio y prostitución. En 1880 se reconstruyó el campanario, y en 1888 el obispo Teodosio transformó el orfanato en una escuela femenina diocesana, que en 1903 se trasladó a un nuevo edificio fuera del monasterio.

En 1918, el monasterio fue cerrado, pero algunas monjas permanecieron allí hasta 1923-1924, hasta que fue finalmente entregado a las necesidades del Ejército Rojo. La catedral de la Asunción permaneció en funcionamiento hasta 1924. Después del desalojo, algunas monjas se establecieron en casas cercanas al monasterio. Durante el período soviético, en el territorio del monasterio se encontraban una prisión de tránsito del NKVD y una unidad militar, y el muro del monasterio fue destruido.

En 1995 comenzó la restauración de la iglesia de la Asunción, y desde 1996 se reanudaron los servicios. La casa del abad y el edificio del orfanato se utilizaron como tiendas y almacenes. El 15 de noviembre de 2014, el metropolitano de Vologda y Kirilov, Ignatios, inspeccionó el cuerpo abacial y decidió formar el monasterio de Gorni-Uspenski con el estatus de residencia archidiocesana. En un año, el antiguo cuerpo abacial fue preparado para la residencia de las hermanas y para albergar la sección de regencia del seminario teológico de Vologda. El 24 de diciembre de 2015, el Santo Sínodo de la Iglesia Ortodoxa Rusa decidió abrir el monasterio y nombrar a la monja Filareta Dorokhina como abadesa. El 26 de diciembre, el metropolitano Ignatios la elevó al dignidad de abadesa.

Después de la resurrección del monasterio, se llevó a cabo una renovación capital de varias habitaciones, se reemplazó parte del techo del antiguo edificio, se creó una granja auxiliar del monasterio, y se desarrollaron la pintura de íconos y la costura.