Les noms des villages et des hameaux étaient généralement donnés par les habitants locaux, basés sur des objets géographiques, des noms de famille souvent rencontrés dans la colonie, des événements historiques ou des noms de paroisses et de prêtres. On peut supposer que le nom du village Arefino provient du mot latin "area", signifiant place ou territoire, et que la seconde partie du mot, "jinn", est liée à la population finno-ougrienne vivant sur ce territoire. Cela est confirmé par le nom mordve de la rivière Idomka, qui coule à Arefino. Il est possible qu'un noble nommé Arefiy ait vécu dans cette colonie dans le passé, et que les habitants aient nommé le village Arefino en son honneur.

Au début du XVIIe siècle, le village d'Arefino et sa paroisse appartenaient au boyard Ivan Nikitovich Romanov. Dans le dernier quart de ce siècle, Arefino est devenu un village de culture de palais de Fiodor Alexeïevitch Romanov. En 1689, le domaine a été donné aux frères Narychkine, et en 1698, il a été attribué à Lev Kirillovitch Narychkine. En 1816, il a été vendu au comte Litta.