Dans la région connue sous le nom de «Poteriaïha», en 1718, grâce aux fonds du noble Pierre Medvedev, une église en bois dédiée à la Sainte Trinité a été fondée, avec une chapelle en l'honneur des Saints apôtres Pierre et Paul. La pose de l'église a eu lieu avec la bénédiction du métropolite sibérien Fiodor Lechtchinski. Le 16 janvier 1721, l'autel de la chapelle en l'honneur des apôtres Pierre et Paul a été consacré dans l'église de la Trinité, ce que fit le constructeur du monastère de l'Ascension d'Irkoutsk, le métropolite Kornili. Les chroniques irkoutskiennes mentionnent qu'en cette année, une inondation a eu lieu sur la rivière Angara, et l'eau près de l'église de la Trinité s'est élevée d'environ un arshin et demi. Pendant la procession autour de l'église, la glace du côté nord s'est brisée.

La même année, le 24 juin, l'archimandrite d' Pékin, Antoine Platkovski, arrivé à Irkoutsk en mars, a consacré l'autel principal du temple au nom de la Sainte Trinité Vivifiante. Plus tard, en avril 1858, le marchand irkoutskien Yakov Stepanovich Maïkov, ayant exercé les fonctions de starosta de l'église de la Trinité pendant plus de vingt ans, a planté de nombreux arbres autour du temple, y compris des pins, des épicéas, des sapins et des cèdres. Ce bosquet a protégé l'église d'un incendie en 1879.

Depuis 1754, la construction de l'église en pierre de la Trinité dans le style baroque sibérien a commencé, avec une solution volumétrique originale et une façade ornée. Même avant l'achèvement de la construction, le 5 mai 1763, une chapelle chaude en l'honneur de la Nativité de la Mère de Dieu a été consacrée. La même année, une tragédie s'est produite : le 19 juillet, à Irkoutsk, la voûte de l'église en pierre de la Trinité en construction s'est effondrée, entraînant la mort de trois personnes. Cet accident a retardé l'achèvement de la construction. En 1775, l'autel principal au nom de la Sainte Trinité Vivifiante a été consacré, et en 1778, l'autel des Saints apôtres Pierre et Paul. En décembre 1785, une cloche pesant 204 pouds a été hissée sur le clocher de l'église de la Trinité.

Entre 1845 et 1847, de nombreuses églises irkoutskiennes, en particulier les anciennes, ont été rénovées. L'église de la Trinité n'a pas fait exception, sa rénovation a été effectuée en 1846. Près de l'église de la Trinité, le 16 janvier 1866, une école primaire paroissiale a été ouverte, située dans la maison du bourgeois irkoutskien S.I. Lévin, qui a gracieusement fourni les locaux. L'année suivante, l'école a déménagé dans la maison du marchand irkoutskien Ivan Nikolaïevitch Khakhilev. Lors de l'inondation du 4 janvier 1870, l'école a été inondée jusqu'au plafond, et les cours ont été temporairement suspendus. Cependant, dès le 21 novembre 1870, l'école paroissiale a rouvert dans un bâtiment spécial de 3×4 sajenes. Au départ, trois garçons et dix filles y ont été instruits.