L'église de la Nativité de Jean-Baptiste est l'un des bâtiments remarquables du style straganov de baroque moscovite. Elle est ornée de décor sculpté qui se distingue sur fond de murs rouges, et surmontée de cinq coupoles, soulignant son importance en tant qu'entrée principale du monastère.

Au XIXe siècle, la peinture murale à la colle à l'intérieur de l'église a été remplacée par de la peinture à l'huile, mettant l'accent sur des scènes de la vie de saint Jean-Baptiste. Les façades ont été peintes en rouge brique, et le décor en pierre blanche a été mis en valeur par un badigeon. En 1872, un nouvel iconostase a été installé dans l'église, qui a été perdu après la fermeture de la Laure en 1919. En 1946, après la restauration du monastère, un nouvel iconostase doré et sculpté dans le style Empire du début du XIXe siècle a été installé dans l'église.

Entre 1974 et 1978, des travaux de restauration significatifs ont été réalisés sur l'église d'entrée. Quatre coupoles latérales, démontées en 1806, ont été restaurées, l'iconostase et la peinture murale à l'intérieur de l'église ont été renouvelées, ainsi que la peinture dans l'arc de la porte.

De 2006 à 2010, l'église a de nouveau été restaurée. Les travaux ont commencé par des recherches historiques et archivistiques, le nettoyage des façades des peintures tardives et l'étude du système de peinture, y compris le rustique en diamant des murs et le décor végétal des éléments en pierre blanche des colonnes et des pilastres. Ces recherches ont permis de commencer la restauration du système de peinture original des façades et la réparation du décor en pierre blanche.

En 2008, les structures et les revêtements des coupoles de l'église ont été réparés, et la dorure des coupoles et des croix a été renouvelée. En 2009-2010, les travaux de restauration des façades ont continué, rétablissant leur peinture polychrome originale en rustique en diamant, la peinture des colonnes sous forme de vigne et la peinture polychrome des corniches et d'autres détails.

De 2013 à 2015, des travaux de restauration de la peinture murale, des carreaux de poêle, des icônes, de l'iconostase, du remplacement des remplissages des fenêtres de la galerie, de la restauration des marches en granit, du système de charpente du toit et du tambour ont été réalisés.