Le premier temple dédié à saint Nicolas le Miracleux a été construit à l'emplacement de la future abbaye en 1675. Plus tard, en 1685, une nouvelle église de Nicolas a été consacrée, devenant la deuxième de l'abbaye. Selon une description de 1732, l'église était basse, avec un transept du côté nord, une salle à manger et un porche. Elle avait un toit à quatre pentes sans coupole, et la croix était recouverte de fer blanc. Les portes royales de l'église étaient peintes. Contrairement à l'église de la Trinité, le temple de Nicolas était chauffé en hiver, mais il a été démoli en 1763 en raison de sa vétusté.

En 1797, à l'emplacement du temple de Nicolas, une nouvelle église en bois a été construite au nom des apôtres Pierre et Paul. En 1875, le toit a été recouvert de fer. Selon I. Tokmakov, à la fin du XIXe siècle, l'église conservait un iconostase à cinq niveaux du XVIIe siècle avec des images apportées lors de la fondation du monastère. En 1893, la restauration a été achevée : un fondement en pierre a été posé, deux couronnes inférieures ont été remplacées et le porche et la galerie ont été reconstruits. Le temple a été chauffé, mais le 31 décembre 1897, il a brûlé.

Entre 1900 et 1904, à l'emplacement de l'église Saint-Pierre et Saint-Paul brûlée, un temple en pierre a été érigé au nom de saint Nicolas le Miracleux, consacré en juin 1905. Avec l'autel, la longueur du temple était de 33 mètres. L'architecture de l'église de Nicolas combinait des éléments caractéristiques de l'époque de construction et d'une période antérieure. Le temple avait cinq coupoles, avec des divisions verticales et horizontales minimales sur les murs. Les façades étaient ornées d'une corniche en bois courbe, souvent rencontrée dans les bâtiments résidentiels urbains. Une partie importante de l'architecture était les encadrements monumentaux des ouvertures de portes sur les façades sud et nord.

Au début de la renaissance du monastère, les surélévations au-dessus de la corniche principale ont été enlevées, et le bâtiment avait un toit ordinaire. D'ici 2012, le temple a de nouveau retrouvé son bulbe à cinq coupoles.