El primer templo dedicado al santo Nicolás fue construido en el lugar de la futura comunidad en 1675. Más tarde, en 1685, se consagró una nueva iglesia de Nicolás, que se convirtió en la segunda de la comunidad. Según una descripción de 1732, la iglesia era baja, tenía un corte en el lado norte, un refectorio y un pórtico. Tenía un techo de cuatro lados sin cúpula, y la cruz estaba cubierta de hierro blanco. Las puertas reales de la iglesia estaban pintadas. A diferencia de la iglesia de la Trinidad, el templo de Nicolás se calentaba en invierno, pero fue desmantelado en 1763 debido a su deterioro.

En 1797, en el lugar del templo de Nicolás, se construyó una nueva iglesia de madera en honor a los apóstoles Pedro y Pablo. En 1875, el techo fue cubierto de hierro. Según I. Tokmakov, a finales del siglo XIX, en la iglesia se conservaba un iconostasio de cinco niveles del siglo XVII con imágenes traídas al fundar el monasterio. En 1893 se completó la restauración: se construyó un cimiento de piedra, se reemplazaron dos anillos inferiores y se reconstruyeron el pórtico y la galería. El templo se hizo calefaccionado, pero el 31 de diciembre de 1897 se incendió.

Entre 1900 y 1904, en el lugar de la iglesia de Pedro y Pablo que se había quemado, se erigió un templo de piedra en honor al santo Nicolás, consagrado en junio de 1905. Con el altar, la longitud del templo fue de 33 metros. La arquitectura de la iglesia de Nicolás combinaba elementos característicos de la época de construcción y de un período anterior. El templo tenía cinco cúpulas, con mínimas divisiones verticales y horizontales en las paredes. Las fachadas estaban adornadas con un cornisa de madera curva, común en los edificios residenciales urbanos. Una parte importante de la arquitectura eran los marcos monumentales de las puertas en las fachadas sur y norte.

Al comienzo de la renovación del monasterio, las estructuras por encima del cornisa principal fueron retiradas, y el edificio tenía un techo común. Para 2012, el templo volvió a tener una cúpula bulbosa de cinco cabezas.