Dans les années 90 du XIXe siècle, l'église archiépiscopale de Kazan est devenue l'un des objets clés de la résidence archiépiscopale de Biysk, formant son apparence unique. C'est l'une des plus anciennes églises conservées et en activité à Biysk. L'église, construite en briques rouges avec des coupoles bleues, se tenait sur une élévation et était le principal temple de la résidence archiépiscopale et de la mission spirituelle d'Altaï. Avant elle, à cet endroit se trouvait une église en bois dédiée à l'icône de Kazan de la Mère de Dieu, qui a brûlé en 1886 avec la maison archiépiscopale.

Après la restauration de la maison archiépiscopale, la construction de la nouvelle église en briques de Kazan a commencé. Le 16 mars 1888, l'évêque de Biysk, Macaire Nevski, s'est adressé à l'évêque de Tomsk et de Semipalatinsk, Isaac, pour demander l'approbation du plan et de la façade de l'église et la permission de sa construction. L'autorisation a été obtenue.

Le temple a été construit grâce à des dons caritatifs et des fonds collectés par les paysans du district minier d'Altaï en mémoire de l'Empereur Alexandre II. Un apport significatif a été fait par le marchand de Biysk A.F. Morozov. De plus, 1 000 roubles pour la construction ont été reçus des héritiers du marchand de Biysk N.P. Firsov.

Le 8 novembre 1892, l'évêque de Biysk, Vladimir Sinkovski, a consacré l'église. Cet événement coïncidait avec la célébration du centenaire de la naissance de l'archimandrite Macaire Gloukhariev, fondateur de la mission spirituelle d'Altaï.

Un clocher en briques avec un porche a été ajouté à l'église plus tard, probablement en 1903, grâce aux fonds du doyen de l'église. Depuis 1899, pendant vingt ans, les fonctions de doyen de l'église ont été exercées par le marchand de Biysk V.M. Rybakov. L'ancienne cloche a été démolie après la construction de la nouvelle.

L'église avait un sous-sol, situé en dessous du niveau du sol, qui était peut-être destiné à l'organisation d'une crypte. Le jour de la consécration de l'église de Kazan, une discussion populaire a eu lieu en son sein, dédiée à l'archimandrite Macaire Gloukhariev.

L'intérieur du temple était décoré d'un iconostase en bois sculpté et doré, probablement fabriqué dans l'atelier d'iconostases de Biysk d'A.A. Borzenkov. Pour sa réalisation, 2 200 roubles ont été donnés par le marchand A.V. Sokolov, qui a reçu des remerciements archiépiscopaux.

Le temple était bien approvisionné en ustensiles. En 1890, pendant la construction, à la demande du protodiacre de Moscou, Jean de la Nativité, et avec la permission du métropolite Joanniki, les églises et monastères de Moscou ont fait don de vêtements liturgiques et d'objets d'ustensiles d'église.

Par décret du Saint-Synode du 5 avril 1905, le clergé devait comprendre deux prêtres, un diacre et deux psalmistes. Les prêtres principaux étaient le prêtre Alexis Sokolov et le protodiacre Pierre Benediktov, qui se succédaient. Le diacre depuis 1904 était E.M. Yachmenev, diplômé de l'école missionnaire de catéchistes de Biysk.

En 1915, le clergé de l'église était composé du protodiacre Pierre Benediktov, du prêtre Alexis Sokolov, du diacre Trofim Tchernykh et des psalmistes Dimitri Krivykh, Fiodor Pechenin et Sergueï Troïtski.

L'église possédait deux chapelles en pierre : la chapelle Nicolas sur la place de la foire et la chapelle Iverskaya sur la place du marché. Des services archiépiscopaux étaient souvent célébrés dans l'église, attirant de nombreuses personnes. En 1920, les prêtres de l'église étaient Pierre Spodateiko et Bartholomé Chuklin.

Dans les années 1920, l'église est passée sous la direction de l'organisation rénovatrice « Église vivante ». En mars 1926, un congrès du clergé et des laïcs rénovateurs s'est tenu ici. En avril 1926, le prêtre Sergueï Srebrianski était le recteur, puis le protodiacre Sergueï Stakhiev, récompensé par une croix dorée.

En 1930, le temple a été fermé pour les services religieux. Lors de la réunion du présidium du comité exécutif du district de Biysk le 10 août 1930, il a été décidé de transférer le bâtiment au conseil municipal pour en faire un club en raison de l'absence de communauté et du refus de payer des impôts.

Derrière l'autel de l'église se trouvait un nécropole avec environ une centaine de tombes. L'examen des livres métriques a révélé les noms de 73 enterrés. La fermeture de l'église a conduit à la destruction de la nécropole.

En 2011, une plaque en fonte de la tombe de l'hiéromoine Paul a été transférée au Musée de l'histoire de la mission spirituelle d'Altaï.

Pendant les années soviétiques, le bâtiment a été utilisé comme écurie, club, entrepôt et stand de tir. En 1990, l'église a été restituée aux croyants, et des travaux de restauration ont commencé. La seconde consécration du temple a eu lieu le 6 juin 1994. En 2013, l'église a retrouvé son nom historique en l'honneur de l'icône de Kazan de la Mère de Dieu.

Parmi les reliques de l'église de Kazan, une copie de l'icône du saint Panteleimon du mont Athos, l'icône du saint Dimitri de Rostov et d'autres. Le temple joue un rôle important dans la vie spirituelle de Biysk et de l'évêché de Biysk.