En los años noventa del siglo XIX, la iglesia archidiocesana de Kazán se convirtió en uno de los objetos clave del convento archidiocesano de Biysk, formando su aspecto único. Es una de las iglesias más antiguas que se han conservado y que aún están en funcionamiento en Biysk. La iglesia, construida de ladrillo rojo con cúpulas azules, se erguía en una elevación y era el templo principal del convento archidiocesano y de la misión espiritual de Altai. Antes de ella, en este lugar había una iglesia de madera dedicada a la Icono de Kazán de la Madre de Dios, que se quemó en 1886 junto con la casa del obispo.

Después de la restauración de la casa del obispo, comenzó la construcción de la nueva iglesia de ladrillo de Kazán. El 16 de marzo de 1888, el obispo de Biysk, Macario Nevsky, se dirigió al obispo de Tomsk y Semipalatinsk, Isaak, solicitando la aprobación del plan y la fachada de la iglesia y el permiso para su construcción. Se obtuvo el permiso.

El templo se construyó con donaciones benéficas y fondos recaudados por los campesinos del distrito minero de Altai en memoria del emperador Alejandro II. Una contribución significativa fue hecha por el comerciante de Biysk A.F. Morozov. También se recibieron 1,000 rublos para la construcción de los herederos del comerciante de Biysk N.P. Firsov.

El 8 de noviembre de 1892, el obispo de Biysk, Vladimir Sinykovsky, consagró la iglesia. Este evento coincidió con la celebración del centenario del nacimiento del archimandrita Macario Glukharev, fundador de la misión espiritual de Altai.

La torre de campanas de ladrillo con un vestíbulo fue añadida a la iglesia más tarde, probablemente en 1903, con fondos del anciano de la iglesia. Desde 1899, durante veinte años, las funciones de anciano de la iglesia fueron desempeñadas por el comerciante de Biysk V.M. Rybakov. La antigua campanario fue demolida después de la construcción de la nueva.

La iglesia tenía un sótano, situado por debajo del nivel del suelo, que posiblemente estaba destinado a la organización de una cripta. En el día de la consagración de la iglesia de Kazán, se llevó a cabo una conversación popular en él, dedicada al archimandrita Macario Glukharev.

El interior del templo estaba decorado con un iconostasio tallado y dorado, probablemente fabricado en el taller de iconostasio de Biysk de A.A. Borzenkov. Para su construcción, el comerciante A.V. Sokolov donó 2,200 rublos, por lo que recibió agradecimiento del archipastor.

El templo estaba bien provisto de utensilios. En 1890, durante la construcción, a solicitud del proto- sacerdote moscovita Ioann Rozhdestvensky y con el permiso del metropolitano Ioannikiy, las iglesias y monasterios de Moscú donaron vestimentas litúrgicas y objetos de utensilios eclesiásticos.

Por decreto del Santo Sínodo del 5 de abril de 1905, se asignaron dos sacerdotes, un diácono y dos salmistas al clero. Los sacerdotes principales fueron el sacerdote Alexey Sokolov y el proto-sacerdote Petr Benediktov, que se alternaban. Desde 1904, el diácono fue E.M. Yachmenev, graduado de la escuela catequista misionera de Biysk.

En 1915, el clero de la iglesia estaba compuesto por el proto-sacerdote Petr Benediktov, el sacerdote Alexey Sokolov, el diácono Trofim Chernykh y los salmistas Dmitry Krivykh, Fyodor Pechenin y Sergey Troitsky.

La iglesia poseía dos capillas de piedra: la de Nicolás en la Plaza de la Feria y la Iverskaya en la Plaza del Mercado. En la iglesia a menudo se celebraban servicios eclesiásticos archidiocesanos, que atraían a muchas personas. En 1920, los sacerdotes de la iglesia eran Petr Spodateiko y Varfolomey Shuklin.

En la década de 1920, la iglesia pasó a estar bajo la administración de la organización renovadora "Iglesia Viva". En marzo de 1926, se celebró aquí un congreso del clero y laicos renovadores. En abril de 1926, el sacerdote Sergiy Srebryansky fue el rector, y luego el proto-sacerdote Sergiy Stakhiev, quien fue galardonado con una cruz dorada.

En 1930, la iglesia fue cerrada para servicios. En la reunión del presidium del comité ejecutivo del distrito de Biysk el 10 de agosto de 1930, se decidió transferir el edificio al consejo municipal para un club debido a la falta de comunidad y la negativa a pagar impuestos.

Detrás del altar de la iglesia había un necrópolis con alrededor de cien tumbas. La investigación de los libros métricos reveló los nombres de 73 enterrados. El cierre de la iglesia llevó a la destrucción del necrópolis.

En 2011, se entregó una losa de hierro fundido de la tumba del hieromonje Pavel al Museo de Historia de la Misión Espiritual de Altai.

En los años soviéticos, el edificio se utilizó como establo, club, almacén y polígono de tiro. En 1990, la iglesia fue devuelta a los creyentes, y comenzaron las obras de restauración. La segunda consagración del templo tuvo lugar el 6 de junio de 1994. En 2013, la iglesia recuperó su nombre histórico en honor a la Icono de Kazán de la Madre de Dios.

Entre las reliquias de la iglesia de Kazán se encuentran una copia de la icono del santo Panteleimon de Athos, la icono del santo Dimitri de Rostov y otros. El templo juega un papel importante en la vida espiritual de Biysk y de la diócesis de Biysk.