Le trône archangélique à Kolomna remonte à environ le milieu du XIVe siècle. Au XVIe siècle, un complexe de deux églises s'est formé ici : le Miracle de l'Archange Michel à Khoné et la Cathédrale de l'Archistratège Michel. À cette époque, dans le mur de la forteresse en bois de Kolomna, entre les tours de Marinkina et Granovitaya, il existait déjà des portes de passage, appelées portes de Mikhaïlovski, et le quartier au pied du kremlin en face d'elles est devenu connu sous le nom de Mikhaïlovskaïa, parfois Archangelskaïa. Après le Temps des Troubles, l'église est tombée en ruine. En 1700, grâce aux fonds des paroissiens, une église en pierre de l'Archange Michel avec une chapelle des Trois Saints a été construite. L'aspect moderne de l'église a été acquis après la reconstruction de parties de l'ancienne église en pierre. En 1806, grâce aux marchands de Kolomna Roman, Avksentiy et Yakov Kolesnikov, la salle à manger a été reconstruite et agrandie, où des chapelles ont été aménagées en l'honneur de l'icône de Kazan de la Mère de Dieu et des Trois Saints. En 1828 et 1833, ces mêmes marchands, avec les frères Vavila et Vasily Konstantinov, ont effectué une reconstruction majeure de l'église. Dans la partie froide de l'église, le principal autel a été consacré en l'honneur de la Cathédrale de l'Archistratège Michel et des autres Puissances Célestes incorporelles, tandis que dans la salle à manger, les autels étaient consacrés en l'honneur de l'icône de Kazan de la Mère de Dieu, des Trois Saints et des martyres Véra, Nadejda, Lioubov et leur mère Sofia. La partie la plus ancienne de l'église restait le clocher. En 1906, grâce aux fonds du vieux de l'église et bienfaiteur Ioann Postnikov, une chapelle du vénérable Séraphim de Sarov a été aménagée dans la salle à manger. Au début du XXe siècle, un complexe d'église à cinq autels s'est formé. Trois autels, le central, de la cathédrale des puissances de l'Archistratège Michel et deux latéraux, de l'icône de Kazan de la Mère de Dieu et des Trois Saints, se trouvaient dans l'église d'été. Deux autres étaient situés dans la salle à manger chaude du vénérable Séraphim de Sarov et des martyres Véra, Nadejda, Lioubov et leur mère Sofia. C'était l'église la plus grande et l'une des plus riches de Kolomna. Dans les années 1930, l'église a été fermée, le clocher a été détruit. Le bâtiment a été utilisé comme entrepôt, puis comme bureau. En 1936, le bâtiment a été transféré au musée local de Kolomna. En 2006, l'administration de la ville a décidé de transférer le musée dans un autre bâtiment, et l'année suivante, l'église de l'Archistratège Michel a été restituée à l'Église pour restauration et services religieux. Grâce aux fonds du gouvernement de la région de Moscou, en 2007, à l'occasion de la célébration de la Journée de l'écriture et de la culture slaves, la partie du sanctuaire et le cube de l'église ont été restaurés. En sept mois, le toit a été remplacé, le toit du sanctuaire et de la rotonde a été recouvert de cuivre, la croix et le dôme ont été refaits et dorés, la façade a été crépie, les ornements en pierre blanche ont été restaurés et de nouvelles fenêtres ont été insérées. La restauration intérieure a été réalisée grâce aux fonds de l'éparchie de Moscou. En quatre mois, les cloisons intérieures ont été démontées, les fissures de la voûte ont été renforcées et réparées, les sols en pierre blanche ont été restaurés, les murs ont été crépis et le système de chauffage a été entièrement remplacé. En mai 2007, un iconostase de Palekh a été installé dans l'église, offert par Son Éminence Juvenaly, métropolite de Kolomna et de Kroutitski. Le 28 mai, le jour de la Sainte Trinité, la première Divine Liturgie a eu lieu dans l'église. En 2008, le clocher de l'église a été entièrement restauré. Le 21 novembre 2008, l'église de l'Archange Michel, la plus spacieuse de Kolomna, a été solennellement consacrée par la Grande Consécration, célébrée par Son Éminence Juvenaly, métropolite de Kolomna et de Kroutitski.