El altar del Arcángel en Kolomna se remonta aproximadamente a mediados del siglo XIV. Para el siglo XVI, se formó aquí un complejo de dos templos: el Milagro del Arcángel Miguel en Jonej y la Catedral del Arcángel Miguel. En ese momento, en la pared de la fortaleza de madera de Kolomna, entre las torres Marinkina y Granovita, ya existían puertas de paso, llamadas Mikhailovskie, y el asentamiento al pie del kremlin frente a ellas se conocía como Mikhailovskaya, a veces también como Arkhangelskaya. Después del tiempo de disturbios, el templo quedó en ruinas. En 1700, con los fondos de los feligreses, se construyó una iglesia de piedra dedicada a Miguel el Arcángel con una capilla de los Tres Santos. La apariencia moderna del templo se adquirió tras la reconstrucción de partes de la iglesia de piedra anterior. En 1806, gracias a los comerciantes de Kolomna, Roman, Avksentiy y Yakov Kolesnikov, se reconstruyó y amplió el refectorio, donde se organizaron capillas en honor a la icono de Kazán de la Madre de Dios y los Tres Santos. En 1828 y 1833, los mismos comerciantes junto con los hermanos Vavila y Vasiliy Konstantinov llevaron a cabo una reconstrucción capital de la iglesia. En la parte fría del templo se consagró el altar principal en honor a la Catedral del Arcángel Miguel y otras Fuerzas Celestiales incorpóreas, y en el refectorio, los altares en honor a la icono de Kazán de la Madre de Dios, los Tres Santos y las mártires Vera, Nadezhda, Lyubov y su madre Sofía. La parte más antigua de la iglesia seguía siendo el campanario. En 1906, con los fondos del anciano de la iglesia y benefactor Ioann Postnikov, se organizó una capilla en el refectorio en honor al venerable Serafim de Sarov. A principios del siglo XX, se formó un complejo de templo de cinco altares. Tres altares, el central, de la catedral de las fuerzas del Arcángel Miguel y dos laterales, de la icono de Kazán de la Madre de Dios y los Tres Santos, estaban en el templo de verano. Otros dos se ubicaban en el cálido refectorio del venerable Serafim de Sarov y las mártires Vera, Nadezhda, Lyubov y su madre Sofía. Era el templo más grande y uno de los más ricos en Kolomna. En la década de 1930, la iglesia fue cerrada y el campanario fue destruido. En el edificio se instaló un almacén y luego una oficina. En 1936, el edificio fue transferido al Museo de Historia Local de Kolomna. En 2006, la administración de la ciudad decidió trasladar el museo a otro edificio, y al año siguiente, el templo del Arcángel Miguel fue devuelto a la Iglesia para su restauración y servicios religiosos. Con los fondos del Gobierno de la Región de Moscú, en 2007, para celebrar el Día de la Escritura y Cultura Eslava, se restauraron la parte del altar y el cubo del templo. En siete meses se reemplazó el techo, se cubrió el techo del altar y la rotonda con cobre, se fabricó y doró de nuevo la cruz y la cúpula, se enlució la fachada, se restauraron las decoraciones de piedra blanca y se insertaron nuevas ventanas. La restauración interior se llevó a cabo con fondos de la Diócesis de Moscú. En cuatro meses se desmontaron los tabiques interiores, se reforzaron y sellaron las grietas del arco, se restauraron los pisos de piedra blanca, se enlucieron las paredes y se reemplazó completamente el sistema de calefacción. En mayo de 2007, se instaló en el templo un iconostasio de Palekh, donado por Su Eminencia Juvenal, Metropolitano de Kolomna y Krutitsy. El 28 de mayo, en el día del Espíritu Santo, se celebró la primera Divina Liturgia en el templo. En 2008, se restauró completamente el campanario del templo. El 21 de noviembre de 2008, la iglesia del Arcángel Miguel, la más grande en Kolomna, fue solemnemente consagrada con una gran consagración, que fue realizada por Su Eminencia Juvenal, Metropolitano de Kolomna y Krutitsy.