Le temple de l'apôtre Philippe et de Nicolas le Miracle-Faire sur la rue Nutna à Novgorod appartient à l'éparchie de Novgorod de l'Église orthodoxe russe. La première église en pierre à cet endroit a été construite en 1383-1384 par les posadniks Rodislav Danilovitch, Ustin et Philippe.

Les églises dédiées à l'apôtre Philippe et à Nicolas le Miracle-Faire ont été érigées en 1527-1528 par des marchands novgorodiens et moscovites. Ces deux églises paroissiales reposaient sur une fondation commune. Au fil du temps, elles ont été reconstruites à plusieurs reprises, et en 1608, les deux paroisses ont fusionné en une seule. Au XVIIe siècle, une cloche a été ajoutée aux églises avec un toit en forme de tente.

En 1899, l'église de Nicolas le Miracle-Faire a été presque entièrement démolie, ne laissant que le mur ouest, des traces sur le mur de l'église de l'apôtre Philippe et des restes de fondations.

Après la campagne antireligieuse de Khrouchtchev, cette église est restée la seule en activité dans la ville. L'archevêque Léon Tserpitski se souvenait qu'il était difficile de prier lors des grandes fêtes en raison du grand nombre de personnes rassemblées.

Après l'annexion de l'éparchie de Novgorod à celle de Leningrad, le métropolite de Leningrad Nikodim Rotov venait souvent ici pour célébrer. Il visitait le temple lors de la fête de l'icône de la Mère de Dieu de Znamenié, le jour de saint Nikita et plusieurs fois pendant le Grand Carême. Peu à peu, il a commencé à amener des délégations étrangères, ce qui a suscité le mécontentement des autorités locales. Novgorod était une ville fermée, et le métropolite devait déployer des efforts pour organiser ces voyages. Avec le temps, cela est devenu habituel, et il est devenu possible d'installer un nouvel iconostase dans le style ancien russe dans le temple.

Entre 1969 et 1970, des mesures et des études du monument ont été réalisées, révélant les restes des murs de l'église de Nicolas et un projet de restauration a été élaboré. Cependant, à Moscou, l'extension du temple a été interdite, et le métropolite Nikodim Rotov a lutté pendant près de 10 ans pour annuler cette décision.

Ce n'est qu'après la signature par l'URSS des accords d'Helsinki en 1977 que les travaux de construction selon le projet de N. N. Kouzmine ont commencé. Le monument architectural a été restauré dans les formes du XVIe siècle, tout en conservant le porche ouest et la cloche du XVIIIe siècle.