Le village de Ragounovo se trouvait autrefois sur une île éponyme au centre du lac. La chapelle Nicolas dans ce village ancien a été construite vers le début du XIXe siècle. À l'origine, elle se composait d'un bâtiment principal et de petites vérandas. Dans la salle de prière, il y avait deux fenêtres identiques avec une construction à trois vantaux, situées au nord et au sud, qui ont été conservées dans leur état d'origine. Les vérandas n'avaient pas de fenêtres et étaient éclairées uniquement par une porte entrouverte. Le bâtiment principal et les vérandas étaient couverts d'un toit en bois commun. À l'origine, la toiture était traditionnelle, comme en témoignent les traces de deux poules sur les couronnements supérieurs. La chapelle se terminait probablement par une simple croix. À en juger par l'absence de traces sur le mur ouest, il n'y avait pas de porche.

Lors de la deuxième phase de construction, les murs de la chapelle ont été recouverts de larges planches à bords profilés, fixées avec des clous forgés. Cela s'est probablement produit en 1880, comme le confirme l'inscription sur le linteau de porte conservé. À cette époque, il est probable que la toiture ait été remplacée par une simple toiture en bardeaux, également fixée avec des clous forgés. Il est possible qu'un porche ait été ajouté, car une colonne sculptée a été retrouvée dans une annexe tardive, réutilisée. L'apparence de la chapelle à cette étape soulève de nombreuses questions.

À la dernière étape de la construction, au début du XXe siècle, les vérandas ont été agrandies en découpant le mur ouest et en ajoutant une annexe à ossature. Une fenêtre a été faite dans le mur sud de l'annexe. La nouvelle entrée a été aménagée avec une large ouverture à arc et des portes à deux battants. Devant l'entrée, un porche ouvert est apparu avec de fines colonnes sculptées et un toit à deux pentes. Il est probable qu'à cette étape, un bulbe ait également été ajouté. La chapelle était entourée d'une clôture, qui ne s'est pas conservée, mais est visible sur une ancienne photo. Son emplacement peut être déterminé par les rochers enfoncés dans le sol.

Entre 2011 et 2013, la chapelle Nicolas a été restaurée. Le financement des travaux a été principalement assuré par V.I. Egorov. Les questions organisationnelles et la préparation des matériaux ont été prises en charge par le parc national et personnellement par le directeur adjoint V.M. Goudym. Les travaux ont été réalisés par des charpentiers de la ville d'Onega : V.I. Kazakov, S.V. Golovchenko, V.I. Rogatchev, ainsi qu'un habitant local, V. Bely.