L'abbaye féminine à l'emplacement du monastère de Blagoveshchensk à Astrakhan a été fondée il y a plus de trois siècles. Avant cela, il y avait le vieux monastère masculin de l'Ascension, la première construction ecclésiastique en dehors du Kremlin d'Astrakhan et de la ville blanche. Le monastère était pauvre, ses bâtiments étaient principalement en bois. Une église en pierre a été tentée d'être construite depuis le début du XVIIe siècle, mais elle n'a été consacrée qu'en 1699, plus d'un demi-siècle après la pose de la première pierre.

Le monastère de l'Ascension a été aboli en 1706, et à sa place a été établi un monastère féminin, renommé en monastère de Blagoveshchensk. Selon les témoignages conservés, les moniales vivaient auparavant dans le monastère féminin d'Astrakhan, mentionné en 1614 et 1619. Il est probable que les sœurs de ce temple, avec les moniales du monastère de la Sainte Vierge, se soient installées dans le monastère de l'Ascension aboli. Cela explique l'apparition d'une chapelle en l'honneur de la martyre Parascève dans l'église cathédrale du monastère de Blagoveshchensk.

De 1848 à 1851, plusieurs bâtiments monastiques et une partie du mur nord effondré ont été rénovés. Les vieux murs ont été réparés plusieurs fois, mais leur aspect final n'a été acquis qu'au début du siècle suivant. À la même époque, il a été décidé de reconstruire complètement à Astrakhan le vieux temple de Saint-Jean-l'Évangéliste, sans conserver son intérieur d'origine. En octobre 1865, l'église rénovée a été consacrée.

En 1894, un incendie a ravagé le monastère de Blagoveshchensk, détruisant deux bâtiments en bois, un garage, une écurie, le bâtiment de l'école paroissiale, la salle à manger pour les moniales, une cuisine en pierre avec des celliers et des granges à bois, ainsi qu'un pavillon en pierre pour la supérieure.

Dans les années suivantes, les bâtiments détruits et endommagés ont été restaurés. En 1896, une nouvelle maison de plain-pied a été construite pour la supérieure. La même année, la société municipale a fait don d'un terrain au monastère, où deux ans plus tard, une école paroissiale en pierre a été érigée. Au cours des dix années suivantes, les autres bâtiments incendiés ont été restaurés.

En 1900 et 1901, la chapelle de Saint Nicolas, située dans le coin sud-est du monastère et en état d'urgence, a été reconstruite. En 1900, elle a été démolie, et un an plus tard, le nouveau bâtiment a été consacré.

En 1907, un nouveau clocher dans le style ancien russe a été construit au monastère, situé au-dessus des portes sacrées, l'entrée principale du monastère. Il était surmonté d'un dôme avec une pomme dorée et une croix à huit branches. À l'intérieur de l'église, des iconostases dorées sculptées décoraient à la fois le chœur central et les chapelles latérales. Elles ont été créées au début du XVIIIe siècle et ont été rénovées plusieurs fois, la dernière fois en 1908 et 1909, lorsque les anciennes icônes ont été remplacées par de nouvelles. À cette époque, la peinture de l'église a également été mise à jour.

Avec l'arrivée du pouvoir soviétique, le monastère a été aboli. Ses locaux ont été utilisés comme hôpital, unité militaire et orphelinat. Lorsque le bâtiment a été occupé par l'orphelinat n°6 et un établissement pour enfants avec des défauts moraux, les moniales ont été expulsées, bien que les églises soient restées à leur disposition.

En 1930, les églises et le clocher sur le territoire du monastère ont été complètement détruits. Certaines cellules en bois ont été utilisées par des particuliers. En 1949, la majeure partie du monastère a été transférée au bureau d'enregistrement militaire de la région d'Astrakhan. Au début des années 1990, une partie du mur nord s'est effondrée, et un tiers du mur a été restauré. Les travaux de restauration du monastère ont commencé en 2008. En premier lieu, les murs et les tours ont été remis en état, et la chapelle de Saint Nicolas a été réparée et ouverte aux fidèles. En 2014, des travaux de conservation de la clôture ont été réalisés, le monument a été nettoyé de l'ancienne peinture, de la moisissure et de la saleté, traité avec des compositions spéciales, les surfaces endommagées de la maçonnerie en brique ont été restaurées et le monument a été repeint.