La comunidad femenina en el lugar del monasterio de Blagoveshchensk en Astracán fue fundada hace más de tres siglos. Antes de esto, aquí se encontraba el antiguo monasterio masculino de la Ascensión, la primera construcción religiosa fuera del Kremlin de Astracán y de la Ciudad Blanca. El monasterio era pobre, sus edificios eran principalmente de madera. Se intentó construir una iglesia de piedra desde principios del siglo XVII, pero fue consagrada solo en 1699, más de medio siglo después de la colocación de la primera piedra.

El monasterio de la Ascensión fue disuelto en 1706, y en su lugar se estableció la comunidad femenina, renombrando el monasterio a Blagoveshchensk. Según los testimonios conservados, las monjas anteriormente vivían en el monasterio femenino de Astracán, mencionado en 1614 y 1619. Probablemente, las hermanas de este templo junto con las monjas del monasterio de San viernes se trasladaron al disuelto monasterio de la Ascensión. Esto explica la aparición de una capilla en honor a la mártir Paraskeva de viernes en la iglesia catedral del monasterio de Blagoveshchensk.

Desde 1848 hasta 1851, se repararon varios edificios del monasterio y parte de la pared norte derrumbada. Las viejas paredes fueron reparadas varias veces, pero solo adquirieron su forma definitiva a principios del siglo siguiente. En este mismo tiempo se decidió reconstruir completamente en Astracán la vetusta iglesia de San Juan el Teólogo, sin conservar su interior original. En octubre de 1865, la iglesia renovada fue consagrada.

En 1894, un incendio en el monasterio de Blagoveshchensk destruyó dos edificios de madera, un carruaje, un establo, el edificio de la escuela parroquial, el refectorio para las monjas, una cocina de piedra con despensas y almacenes de leña, así como el ala de piedra de la abadesa.

En los años siguientes se restauraron los edificios destruidos y dañados. En 1896 se construyó una nueva casa de un piso para la abadesa. Ese mismo año, la sociedad de la ciudad donó un terreno al monasterio, donde dos años después se construyó una escuela parroquial de piedra. Durante los siguientes diez años se restauraron los demás edificios quemados.

En 1900 y 1901, en la esquina sureste del monasterio, se reconstruyó la capilla de San Nicolás, que se encontraba en estado de emergencia. En 1900 fue desmantelada, y al año siguiente se consagró el nuevo edificio.

En 1907 se construyó en el monasterio un nuevo campanario en estilo ruso antiguo, ubicado sobre las puertas sagradas, la entrada principal al monasterio. Se coronaba con una cúpula con una manzana dorada y una cruz de ocho puntas. En el interior del templo, los iconostasios dorados y tallados adornaban tanto el altar central como las capillas laterales. Fueron creados a principios del siglo XVIII y renovados varias veces, la última en 1908 y 1909, cuando las viejas imágenes fueron reemplazadas por nuevas. En ese momento también se renovó la pintura del templo.

Con la llegada del poder soviético, el monasterio fue disuelto. Sus instalaciones se utilizaron como hospital, unidad militar y hogar de niños. Cuando se instaló el hogar de niños n.º 6 y una institución para niños con defectos morales en el edificio, las monjas fueron desalojadas, aunque los templos permanecieron a su disposición.

En 1930, los templos y el campanario en el territorio del monasterio fueron completamente destruidos. Algunas celdas de madera fueron utilizadas por particulares. En 1949, la mayor parte del monasterio fue transferida al comité militar regional de Astracán. A principios de la década de 1990, parte de la pared norte se derrumbó, y un tercio de la pared fue restaurado. Los trabajos de restauración del monasterio comenzaron en 2008. En primer lugar, se ordenaron las paredes y torres, se reparó y abrió para los feligreses la capilla de San Nicolás. En 2014 se llevaron a cabo trabajos para preservar la cerca, limpiar el monumento de la pintura vieja, moho y suciedad, tratarlo con compuestos especiales, restaurar las superficies dañadas de la mampostería y pintar el monumento.