El gimnasio fue fundado en 1838 con el objetivo de asegurar un proceso educativo único y continuo más allá de los Urales. Estaba destinado a la formación de funcionarios públicos y maestros de escuela. El plan de estudios incluía la Ley de Dios, el idioma ruso, lenguas antiguas, latín y, hasta 1901, griego, así como historia, matemáticas, física, geografía, cosmografía, lógica, idiomas francés y alemán, derecho, que era enseñado por un miembro del tribunal de distrito de Tomsk, y la propedéutica filosófica, una materia que hoy nos parece un tanto incomprensible. La biblioteca del gimnasio contaba con hasta 15,000 volúmenes y era una de las mejores de la ciudad. En el gimnasio funcionaba una iglesia propia.

Después de la Revolución de 1917 y la Guerra Civil, en 1920 se decidió transformar el gimnasio en la Escuela de Artillería de Tomsk. En 1965 se convirtió en la Escuela Superior Militar de Comando de Comunicaciones de Tomsk.

Actualmente, en el edificio se encuentra la LLC 'Gazprom Transgaz Tomsk'.