El monasterio Rizopolozhensky fue fundado a principios del siglo XIII por el obispo Juan de Rostov-Suzdal. Se hizo conocido gracias a los logros espirituales de la venerable Eufrosinia de Suzdal, en el mundo Teodulia, la hija mayor del santo mártir Miguel, gran príncipe de Chernígov. Aunque Eufrosinia no ocupó cargos de liderazgo en el monasterio, su vida y hazañas elevaron significativamente su estatus, convirtiéndolo en el mejor monasterio femenino de Rusia. Ella tuvo la visión de la futura invasión de Batu y la devastación de Suzdal, pero gracias a sus oraciones, el monasterio permaneció intacto.

Las construcciones de piedra aparecieron en el monasterio en el siglo XVI. Las primeras edificaciones del siglo XIII no se han conservado, siendo la más antigua la construcción de la catedral de tres cúpulas de Rizopolozhensky, datada en la primera mitad del siglo XVI. Las puertas sagradas, que servían como entrada solemne al monasterio, fueron erigidas en 1688 por tres maestros de Suzdal: I. Mamin, A. Shmakov e I. Gryaznov. En honor a la victoria sobre los franceses en la Guerra Patriótica de 1812, se construyó en el territorio del monasterio, bajo la dirección del cantero suzdaliano Kuzmin, una campanario de 72 metros de altura entre 1813 y 1819.

En el siglo XVIII, el monasterio cayó en decadencia debido a la reforma eclesiástica de 1764, que le privó de sus tierras, y a un fuerte incendio en 1769. Fue clasificado en el segundo grado y recibía 500 rublos al año del estado.

El florecimiento del monasterio tuvo lugar en la década de 1870 y estuvo relacionado con el nombre de la igumenia Serafima. Durante este tiempo comenzaron grandes obras de construcción. Según el proyecto del arquitecto de Vladimir Artleben, entre 1879 y 1881 se construyó una nueva iglesia de invierno de Sreten, que reemplazó a la demolida en 1878. En 1901, un fuerte incendio destruyó todos los edificios de madera y dañó los de piedra. Después de esto, se reconstruyeron parcialmente los edificios de piedra, y en lugar de las construcciones de madera se erigieron una celda para el abad, una escuela parroquial y dos cuerpos de celdas, y el patio del monasterio se pavimentó con adoquines.

En 1923, la comisión de liquidación cerró el monasterio, y sus edificios y propiedades fueron transferidos al departamento de museos de Glavkniga. Sin embargo, desde mayo de 1924, por orden del comité ejecutivo del distrito de Vladimir, se alojó en el monasterio una división especial de las tropas de la OGPU para proteger el aislamiento político de Suzdal en el monasterio de Spaso-Evfimiev.

Hasta finales de la década de 1940, el monasterio se utilizó para la protección. Durante este período, apareció en su territorio la calle "Ciudad Comunal". Después de la retirada de la guardia, los edificios del monasterio comenzaron a utilizarse como viviendas. En la catedral de Rizopolozhensky se instaló una central eléctrica, en la iglesia de Sreten, un cine, y en la sala de la refectorio, un club urbano.

En 1999, el monasterio fue entregado a la Iglesia Ortodoxa Rusa y reabierto como monasterio femenino de la diócesis de Vladimir-Suzdal.