Antes de la construcción de la catedral de piedra de la Epifanía, ya existía en el monasterio una iglesia de madera con refectorio, dedicada a San Nicolás de Mira, el milagroso. Según el inventario del monasterio de 1629-1630, además de la catedral de la Epifanía, había una iglesia con refectorio de San Nicolás el Milagroso, la celda del archimandrita, diez celdas de los hermanos, donde vivían veintisiete monjes, cuatro celdas vacías, una panadería, una cocina, un nevero, tres graneros, una casa de entrada y una cerca de madera.

Hoy, el camino al monasterio lleva directamente a la iglesia campanario de San Nicolás, rodeada de dos torres que se han conservado desde la construcción original de 1691. La iglesia de piedra, erigida en 1685 con fondos de los terratenientes de Rostov, los Meschérin, fue seriamente dañada por incendios en 1730 y 1826. Fue reconstruida bajo la dirección del arquitecto P.Ya. Pankov entre 1826 y 1837. En este mismo período se construyó la campanario en estilo neoclásico, y en la fachada occidental apareció un pórtico clásico.