El 28 de enero de 1986, el ministro de educación superior y educación técnica de la RSFSR, I. F. Obraztsov, firmó una orden para la creación del museo de arqueología y etnografía de Altai. Antes de su creación, profesores, empleados del departamento y laboratorio de arqueología, así como estudiantes, realizaron un trabajo de expedición significativo que comenzó en 1974. Investigaron las áreas de Altai montañoso y estepas, realizaron excavaciones y recopilaron un extenso material arqueológico que se convirtió en la base de la exposición del museo. Desde 1978, tras la creación del 'Laboratorio de Arqueología, Etnografía e Historia de Altai', el trabajo para enriquecer los fondos del museo se volvió más dirigido.

Un papel importante en la formación del museo fue desempeñado por la exposición de monumentos arqueológicos de Altai, organizada en 1984 para la llegada de arqueólogos japoneses. Esta se llevó a cabo en el edificio del Museo de Historia de la Educación en Altai.

El primer paso en la formación del museo fue la creación de una exposición arqueológica para la visita del miembro del CC del PCUS, Heydar Aliyev. Esta visita fue importante para la universidad, ya que Vasily Ivanovich Neverov era el representante de Aliyev. En 1985, bajo la dirección de Yuri Fyodorovich Kiryushin, comenzó un trabajo activo para crear la exposición del museo. Yuri Fyodorovich involucró a todos los empleados del laboratorio de arqueología para seleccionar los hallazgos más interesantes del material acumulado. Los arqueólogos exhibieron piezas únicas que abarcan prácticamente todas las culturas arqueológicas.

La primera excursión por el museo fue guiada por Yu. F. Kiryushin, acompañado por el rector de AGU, V. I. Neverov, y otros altos funcionarios. Heydar Aliyev, como historiador, valoró altamente el material arqueológico único recopilado por los empleados del laboratorio.

Posteriormente, los empleados comenzaron a realizar conferencias-excursiones temáticas. La segunda etapa de desarrollo del museo comenzó en otoño de 1985, cuando G. L. Nekhvedavichus comenzó a mejorar la exposición. En ese momento, Vasily Ivanovich Neverov, junto con la administración, preparó y envió documentos al Ministerio para justificar la necesidad de abrir el museo de arqueología.

El museo fue oficialmente inaugurado por orden del ministro I. F. Obraztsov para mejorar el proceso educativo en la Universidad de Altai y recibió el nombre de 'Museo de Arqueología y Etnografía de Altai'.

Los materiales del museo fueron recopilados durante investigaciones de campo realizadas desde 1975 en el territorio de la región de Altai. Los fondos del museo se enriquecen anualmente con nuevos hallazgos. Actualmente, el museo cuenta con más de 100,000 objetos registrados, que pertenecen a diferentes períodos históricos desde el paleolítico medio hasta la baja Edad Media, así como testimonios etnográficos.

Los fondos del museo incluyen secciones de exposición, arqueología, etnografía y antropología, así como un archivo que alberga 77,506 unidades. La sección de exposición cuenta con más de 1,600 unidades de almacenamiento, y el archivo contiene informes de expediciones arqueológicas y materiales de exposiciones etnográficas.

El museo de arqueología de AltGU sirve como base para el trabajo científico de los estudiantes. Sobre su base se llevan a cabo prácticas arqueológicas, etnográficas y pedagógicas, así como clases para estudiantes que estudian museología. El museo proporciona formación práctica a los estudiantes de la facultad de historia, permitiéndoles trabajar con objetos de museo y materiales de exposición.

El museo se dedica activamente a la orientación profesional, realizando conferencias-excursiones científicas y educativas para escolares. El museo recibe hasta 3,000 visitantes al año, y más de 50 especialistas de diferentes universidades del país trabajan con sus fondos. En la base del museo se llevan a cabo conferencias científicas y exposiciones.