A principios del siglo XVIII, Pedro el Grande le regaló a su amigo y compañero, el conde Grigori Stróganov, la aldea de Kuzmínki. Stróganov valoró mucho este regalo y construyó allí no solo una mansión para él, sino también una casa separada para el soberano en caso de su visita.

Tras la muerte de Stróganov en 1715, su viuda erigió en memoria de su esposo el templo de la Icono de la Madre de Dios de Vlajernskaya (calle Académico Skryabin, n.º 1). Junto al templo surgió un cementerio que se convirtió en la base del actual cementerio Kuzmínskoe.

El templo fue consagrado en 1720. La localidad, gracias al templo y a la icono, cambió su nombre de Kuzmínki a Vlajernskoye y permaneció así hasta la revolución, cuando pasó a ser parte del dote de los príncipes Golitsyn.

El templo se quemó a mediados del siglo XVIII, y entre 1759 y 1762 se construyó un nuevo templo de piedra en su lugar, según el proyecto del arquitecto Iván Zherebtsov. Entre 1794 y 1798, el arquitecto Rodión Kazakov lo remodeló. El nuevo templo-capilla de Ksenia de San Petersburgo fue realizado en estilo clasicista y decorado con un tambor luminoso con una cúpula-bélvedere y pórticos toscanos. Esta apariencia se ha mantenido hasta nuestros días, aunque el templo ha sido remodelado en varias ocasiones después de Kazakov.

Inicialmente, el cementerio se encontraba en el parque forestal Kuzmínki. Fragmentos de antiguas tumbas se pueden ver en el parque incluso hoy. En la década de 1960, el antiguo cementerio fue trasladado, y la mayor parte de los entierros se movió al territorio del cementerio moderno.

El nuevo cementerio fue fundado en 1956. Inicialmente, servía para el entierro de los residentes de las aldeas cercanas, pero más tarde se comenzaron a asignar parcelas también para los residentes de nuevos distritos de Moscú. El cementerio consta de partes ortodoxas y musulmanas y rápidamente se convirtió en uno de los más grandes, ocupando ahora 60 hectáreas.

En el centro del cementerio se pueden encontrar los restos de un antiguo mausoleo de concreto. Hasta el cierre del cementerio en la década de 1960, junto a la entrada del mausoleo había una piedra con la inscripción: "Golitsyn, murió el día de su nacimiento en el año 186...".

En el cementerio Kuzmínskoe están enterrados el padre, la madre y el hermano de Alla Pugachova; los padres del exalcalde de Moscú Yuri Luzhkov; el cantante gitano Shandor; el poeta y compositor Igor Sorin del grupo "Ivanushki"; los bardos y periodistas Igor Mikhalev y Boris Vakhnyuk; el piloto de pruebas Konstantin Kokkinaki.

En el cementerio descansan 22 héroes de la Unión Soviética.

A la izquierda de la entrada principal se encuentra un monumento en forma de submarino. Este es un monumento a los marineros que murieron el 4 de julio de 1961 durante la eliminación de un accidente en el reactor nuclear del submarino K-19 durante ejercicios en el Atlántico Norte. Debido a una fuga en el sistema de refrigeración, el reactor se calentó a temperaturas críticas, amenazando con una explosión. Los miembros de la tripulación, que recibieron una dosis mortal de radiación, evitaron la explosión al ensamblar un conducto de respaldo.