La iglesia en nombre de San Juan Bautista se encuentra en la parte noreste del centro histórico de la ciudad. Fue construida con los fondos de la comerciante Alexandra Ivanovna Shkroyeva, que le fueron legados por su esposo, el comerciante de primera guilda Ivan Vasilyevich Shkroev. Desde 1879, ocupó el cargo de alcalde de la ciudad de Kain y era conocido por su filantropía. Según su testamento, se destinaron 60 mil rublos para la construcción de la iglesia de San Juan Bautista y 29 mil rublos para su mantenimiento. Alexandra Ivanovna también se dedicó activamente a la caridad y era respetada entre los ciudadanos. Fue la cuidadora honoraria de la Segunda Escuela Parroquial de Kain, construyó y mantuvo con sus propios fondos dos casas de beneficencia y una escuela parroquial.

Después de finalizar la construcción, la iglesia fue inspeccionada por el arquitecto provincial Kondakov y el ingeniero junior Andrei Dmitrievich Kryachkov, quien posteriormente se convirtió en un conocido arquitecto siberiano. La inspección se llevó a cabo en presencia del rector de la catedral de Spassky, el protoiereo Nikolai Vavilov. El 18 de noviembre de 1904, el obispo de Tomsk, Makariy Nevsky, consagró el templo en nombre del santo profeta y precursor del Señor, Juan. En el pueblo, la iglesia comenzó a ser llamada "Shkroevskaya" en honor a su fundadora.

La parroquia de la iglesia estaba limitada a la ciudad de Kain, y para 1911 contaba con 551 personas. En el templo servían un sacerdote y un salmista.

El edificio de la iglesia completa la perspectiva de las calles Pugacheva y Sverdlova, interrumpiendo la claridad de las líneas rojas de las calles. El perfil de la iglesia ha perdido su posición dominante en la construcción debido a los edificios de varios pisos que la rodean.

La iglesia es un ejemplo de templo sin columnas con una composición longitudinal y axial de tres partes, característica de la arquitectura rusa de finales del siglo XVIII y principios del XIX. A lo largo del eje este-oeste se encuentran secuencialmente el cuadrado del templo con un ábside heptagonal, la sala de la cena y la torre del campanario sobre el vestíbulo con dos capillas. La torre del campanario está hecha en forma de octágono sobre un cuadrado con un remate en forma de tienda. La iglesia tiene siete cúpulas: una sobre la concha del altar, una en el campanario y cinco en el templo principal. Las paredes están construidas de ladrillo "a la vista", y los espacios principales están cubiertos con bóvedas. Los techos tienen un contorno complejo, las cúpulas son de forma bulbosa, los techos son metálicos con un patrón diagonal, y el desagüe exterior está organizado.

La apariencia arquitectónica del edificio ha cambiado: se han perdido dos niveles de la torre del campanario, el remate en forma de tienda, siete cúpulas bulbosas, los revestimientos de los pisos, los vanos de las puertas, las cruces de hierro, la decoración interior, el iconostasio y la lámpara central. Se han reemplazado parcialmente los vanos de las ventanas, se ha modificado la estructura y la configuración de la solea. La fachada sur está cerrada por una adición de ladrillo tardío. Las proporciones y detalles de la torre del campanario, así como la decoración del tambor de ladrillo de la cúpula central, restaurados en 1995-1998, se realizaron con desviaciones de los documentos de archivo. En 2003-2005 se llevaron a cabo trabajos de restauración y recuperación de las cúpulas. En 2008, se desmontó la adición tardía en la fachada sur, y en 2010 se realizaron trabajos de restauración en las fachadas.