Die Kirche zu Ehren des Heiligen Johannes des Täufers befindet sich im nordöstlichen Teil des historischen Zentrums der Stadt. Sie wurde mit Mitteln der Kaufmannswitwe Alexandra Ivanowna Shkroyeva erbaut, die ihr Ehemann, der Kaufmann erster Gilde Ivan Vasilievich Shkroev, ihr vermachte. Ab 1879 war er Bürgermeister von Kain und war bekannt für seine Wohltätigkeit. Laut seinem Testament wurden 60.000 Rubel für den Bau der Johannes-der-Täufer-Kirche und 29.000 Rubel für ihren Unterhalt bereitgestellt. Alexandra Ivanowna engagierte sich ebenfalls aktiv in der Wohltätigkeit und genoss Respekt unter den Bürgern. Sie war Ehrenvorsteherin der Kain Zweiten Gemeindeschule, baute und unterhielt auf eigene Kosten zwei Altenheime und eine kirchliche Schule.

Nach Abschluss des Bauwerks wurde die Kirche vom Provinzarchitekten Kondakov und dem jüngeren Ingenieur Andrei Dmitrievich Kryachkov, der später ein bekannter sibirischer Architekt wurde, inspiziert. Die Inspektion fand im Beisein des Pfarrers der Spasski-Kathedrale, Protopresbyter Nikolai Vavilov, statt. Am 18. November 1904 weihte der Bischof von Tomsk, Makariy Nevsky, die Kirche im Namen des heiligen Propheten und Täufers des Herrn Johannes. Im Volk wurde die Kirche „Shkroevskaya“ genannt, zu Ehren ihrer Stifterin.

Die Gemeinde der Kirche umfasste die Stadt Kain, und bis 1911 zählte sie 551 Personen. In der Kirche dienten ein Priester und ein Psalmodiker.

Das Gebäude der Kirche schließt die Perspektive der Straßen Pugacheva und Sverdlova ab und stört die Klarheit der roten Linien der Straßen. Die Silhouette der Kirche hat ihre dominierende Stellung in der Bebauung aufgrund der umliegenden mehrstöckigen Gebäude verloren.

Die Kirche ist ein Beispiel für einen säulenlosen Tempel mit einer dreiteiligen längsachsigen Komposition, die für die russische Architektur des späten 18., frühen 19. Jahrhunderts charakteristisch ist. Entlang der Achse Ost-West sind nacheinander der quadratische Teil der Kirche mit einer siebenseitigen Apsis, das Speisehaus und der gestufte Glockenturm über dem Vorraum mit zwei Seitenkapellen angeordnet. Der Glockenturm ist in Form eines Achtecks auf einem Quadrat mit einem Zeltdach gestaltet. Die Kirche hat sieben Kuppeln: eine auf der Konche über dem Altar, eine auf dem Glockenturm und fünf auf dem Haupttempel. Die Wände sind aus „unter Verfugung“ gemauertem Ziegel, und die Haupträume sind mit Gewölben überspannt. Die Dächer haben eine komplexe Kontur, die Kuppeln sind zwiebelförmig, die Dacheindeckung ist aus Metall mit diagonalen Mustern, und die Regenrinnen sind nach außen organisiert.

Das architektonische Erscheinungsbild des Gebäudes hat sich verändert: Zwei Geschosse des Glockenturms, das Zeltdach, sieben zwiebelförmige Kuppeln, Fußbodenbeläge, Türöffnungen, eiserne Kreuze, die innere Ausstattung, der Ikonostase und der zentrale Kronleuchter sind verloren gegangen. Teilweise wurden die Fensteröffnungen ersetzt, die Konstruktion und Konfiguration der Solea geändert. Die Südseite ist durch einen späteren Ziegelanbau verdeckt. Die Proportionen und Details des Glockenturms sowie die Gestaltung des Ziegelzylinders der zentralen Kuppel, die in den Jahren 1995-1998 wiederhergestellt wurden, wurden unter Abweichung von den Archivdokumenten ausgeführt. In den Jahren 2003-2005 wurden Restaurierungs- und Wiederherstellungsarbeiten an den Kuppeln durchgeführt. Im Jahr 2008 wurde der spätere Anbau an der Südseite abgerissen, und im Jahr 2010 fanden Restaurierungsarbeiten an den Fassaden statt.