La Iglesia de la Protección de la Santísima Virgen en Izmailovo fue construida en 1671 y 1679 en el lugar de una antigua iglesia de madera, que quedaba de la finca de Nikita Romanov. La construcción fue dirigida por el aprendiz de obras en piedra Iván Kuznechik, y los trabajos fueron realizados por los maestros volgares, los hermanos Medvedev. La decoración de azulejos con el patrón "ojo de pavo real" fue creada por el famoso maestro Stepán Polubes. El iconostasio fue fabricado en el taller de Simón Fiódorovich Ushakov.

En noviembre de 1837, el emperador Nicolás I ordenó crear un gran asilo militar en la isla. En 1918 fue cerrado, y en 1924 y 1926 los edificios fueron remodelados en apartamentos comunales para los empleados de la fábrica de aviación "Salyut". En el antiguo asilo vivían más de 2500 personas. En la iglesia se estableció un almacén, y las estructuras del iconostasio fueron destruidas. Solo se conservaron grandes íconos, que se utilizaron como estantes. En la década de 1960, el local historiador Alexander Kuznetsov descubrió estos íconos, y fueron entregados al Museo de Arte Antirruso. En las décadas de 1970 y 1980, la catedral albergó un almacén del Instituto de Investigación "Informelektro". La iglesia volvió a ser activa en la década de 1990. En 2001 y 2002 se creó un nuevo iconostasio, al que se devolvieron varios íconos conservados de Simón Ushakov.