En 1834, la comunidad evangélico-reformada de Moscú adquirió un terreno en el pequeño callejón de los Tres Santos (dirección actual, propiedad n.º 3), donde se encontraba una casa de piedra construida a finales del siglo XVIII. Diez años después, el arquitecto V.A. Balashov remodeló este edificio para adaptarlo a la celebración de cultos.

Los calvinistas se mudaron aquí desde la colina de Ivanovskaya, procedentes de la Sloboda Alemana. En la Sloboda Alemana, desde 1694, en la esquina de la calle Alemana (hoy en día Bauman) y el callejón Holandés (hoy en día Denisovsky) se erguía una iglesia reformada de ladrillo, junto a la cual fue enterrado el famoso general Franz Lefort, compañero de Pedro I. La iglesia se quemó en el incendio de 1812, y durante un tiempo los servicios se llevaron a cabo en un edificio parcialmente restaurado, hasta que se realizó la mudanza.

Con el tiempo, el número de feligreses aumentó significativamente, y en 1865 el edificio en el callejón de los Tres Santos fue completamente remodelado según el proyecto del arquitecto G.I. von Nissen. La fachada fue decorada en un estilo ecléctico, popular en esa época. Sobre la entrada central apareció una ventana "italiana" de dos partes, y el edificio estaba coronado por un frontón. En 1898 se instaló un órgano en la sala principal, creado por el famoso maestro alemán Ernst Rever. Ahora es reconocido como un monumento de historia y cultura.

La iglesia también era famosa por su organista G. Müller. Entre los feligreses había personalidades conocidas, como el fotógrafo M. Scherer y su socio P. Nabgolts, así como el banquero F. Junker.

En 1913 y 1915, detrás de la iglesia, con fachada hacia el gran callejón de los Tres Santos, se construyó un edificio de tres pisos para la escuela reformada según el proyecto del arquitecto A.E. Erichson, miembro de la comunidad.

Después de la revolución, muchos feligreses emigraron, y el edificio en el callejón de los Tres Santos fue entregado a los cristianos evangélicos, quienes en 1944 se unieron a los bautistas. Durante mucho tiempo, este lugar fue el único abierto para cultos protestantes en Moscú. Por ejemplo, después del cierre y demolición de la iglesia en la calle Voznesenskaya en 1928, aquí encontró refugio la comunidad luterana de San Miguel.

En 1937, parte de las instalaciones de los cristianos evangélicos fue confiscada y convertida en un dormitorio. Los inquilinos solo pudieron ser reubicados en 1965 gracias a la adquisición de tres apartamentos cooperativos con fondos del Consejo All-Union de cristianos evangélicos-bautistas. En el edificio de la antigua escuela reformada se abrió una escuela secundaria, que sigue funcionando hasta hoy.

En 1940, los cristianos evangélicos se unieron a la comunidad moscovita de adventistas del séptimo día. Seis años después, debido al aumento del número de feligreses, se remodeló la sala de oración: a lo largo de las paredes aparecieron galerías para 500 personas, y el balcón frente al órgano se alargó para el coro.

En el verano de 1972, la iglesia fue visitada por el presidente de EE. UU. Richard Nixon durante su visita a Moscú.

Ahora aquí se encuentra la Iglesia Central de los cristianos evangélicos-bautistas de Moscú. En ciertos días, los adventistas del séptimo día también celebran sus cultos. En el edificio se llevan a cabo regularmente conciertos de música de órgano.