El primer templo de madera del desierto de Makariévka fue construido a mediados del siglo XVII y consagrado en honor a la Ascensión del Señor. A principios del siglo XVIII, como lo atestigua la fecha en el antiminsio, 1703, fue reemplazado por un templo de piedra con la misma dedicación. A mediados del siglo XVII, el monasterio prácticamente cesó su actividad, y los servicios en la iglesia de la Ascensión se celebraban solo de vez en cuando por monjes que llegaban. La restauración del monasterio comenzó a finales del siglo XIX. Entre 1835 y 1839, el templo fue renovado y se convirtió en de dos pisos. En el segundo piso se encontraba el altar principal en honor a la milagrosa icono de la Ascensión del Señor, y en el primer piso, el altar derecho en nombre de la Madre de Dios de Vatopedi y el izquierdo en nombre del Santo Makario de Zheltovodsk. La tumba de Isaías, el fundador del desierto, se ubicó en la pared exterior de la capilla de Vatopedi, y su ubicación exacta sigue siendo desconocida. En el templo se encontraban las iconos más veneradas del monasterio: la icono del Santo Makario, traída por Isaías, y la icono de la Madre de Dios de Vatopedi, llevada a principios del siglo XIX desde Athos. La construcción de la iglesia fue financiada por la residente de Sviyazhsk, Nadezhda Ivanovna Savrasova, y la campanario, por el comerciante de Kazán, Yevgraf Alexandrovich Lebedev.