El 19 de febrero de 2005, con la bendición de Su Santidad el Patriarca de Moscú y de toda Rusia Alejo II, se consagró en Valaam la iglesia en honor a la Icono de la Madre de Dios de Valaam. La víspera, en la iglesia inferior de la Catedral de la Transfiguración del Salvador, donde se guarda la venerada copia de la milagrosa Icono de Valaam, se celebró la Vigilia. A la consagración de la iglesia asistieron benefactores del monasterio, entre ellos el Presidente de OAO "Casa de Valores del Complejo de Energía" Sergey Yurievich Rudov, gracias a cuyos esfuerzos y apoyo se restauró y embelleció el templo. También estuvo presente el fundador del Fondo No Lucrativo "Conexión de Generaciones" Alexander Ivanovich Kotelkin y otros. Después de la Divina Liturgia, antes de la cual tuvo lugar la consagración, el abad del monasterio, el archimandrita Pancracio, expresó su agradecimiento a Sergey Yurievich Rudov por su contribución a la restauración del templo.

Las pinturas murales de la iglesia fueron realizadas en 2004 por artistas de la escuela de iconografía del Seminario Teológico de Moscú, basándose en los ejemplos de las pinturas de Dionisio. En la pared norte del templo se representa la composición "De Ti se alegra", en los pegas del templo se presentan imágenes de las iconos más veneradas de la Madre de Dios, y entre los santos en una de las pinturas se encuentra el venerable Nazario Kondratiev.

El abad Nazario fue el constructor de las primeras estructuras de piedra del monasterio de Valaam, incluida la iglesia consagrada el 4 de agosto de 1793 en honor al santo Nicolás. En 1853, la iglesia de Nicolás, ubicada en la parte sur del patio interno, fue abolida debido a la construcción y consagración de un templo en la isla de Krestov en honor al santo Nicolás el Milagroso. En la iglesia abolida se estableció una sacristía para almacenar utensilios e iconos de la iglesia. En 1897, entre los iconos, fue milagrosamente encontrada la Icono de la Madre de Dios de Valaam, de la cual fue sanada una mujer que sufría de una grave enfermedad en las piernas. La aparición de la Madre de Dios confirmó su especial protección sobre Valaam y su presencia en la isla. Las palabras "Allí vivo. Me verás en Valaam", dichas en una visión a la mujer enferma, son una revelación de la Madre de Dios sobre Valaam.

En 1911, en el edificio de la iglesia abolida se abrió un archivo eclesiástico. En la década de 1970, el local se utilizó como tienda y almacén. Desde 1990 hasta 2000, en la antigua iglesia funcionó la sacristía del monasterio. En 1997, por decreto de Su Santidad el Patriarca de Moscú y de toda Rusia Alejo II, se estableció la celebración de la icono de la Madre de Dios "Valaam". La restauración de la iglesia comenzó en 2001, con la bendición de Su Santidad. En 2002, el 10 de julio, durante una visita al monasterio, Su Santidad el Patriarca Alejo II realizó el rito de la pequeña consagración del templo. Actualmente, los trabajos de embellecimiento y pintura del templo están completados: se ha instalado un iconostasio tallado y dorado, quioscos con imágenes y sillas talladas. A petición del benefactor, se creó una copia exacta de la milagrosa icono de la Madre de Dios de Valaam, que se encuentra en Finlandia en el monasterio de Nuevo Valaam, la cual ahora está colocada en la primera iglesia en Rusia dedicada a esta imagen de la Madre de Dios.