La iglesia está situada en la plaza de la Epifanía, frente al monasterio de Spaso-Preobrazhensky. El templo de piedra de cinco cúpulas fue construido entre 1684 y 1693 en el lugar de una antigua iglesia de madera, mencionada ya en el siglo XIII. Su construcción fue financiada por el comerciante Alexei Abramovich Zubchaninov. El templo es sin columnas, de cinco cúpulas, sin sótano, y está rodeado por galerías en tres lados que conducen a los altares. En el lado norte había un altar en memoria del Juicio Final, y en el sur, un cálido altar en nombre de Dimitri de Priluki. Después del incendio de 1753, las viejas cúpulas de madera fueron reemplazadas por nuevas, realizadas en un estilo barroco caprichoso. En la década de 1950, las cúpulas y la decoración de azulejos de la iglesia fueron restauradas según el proyecto de V.N. Zakharova. La fecha exacta de la creación de la pintura del templo es desconocida, pero una inscripción en el altar indica que fue consagrado por el metropolitano de Rostov, Ioasaf, el 2 de julio de 1693. Probablemente, la pintura se completó en 1693, comenzando un año antes. La autoría de la pintura no está establecida, pero la heterogeneidad estilística sugiere la participación de dos diferentes talleres artísticos. La pintura de las bóvedas está realizada en un estilo monumental con una vibrante paleta de colores y, probablemente, pertenece al taller de Dmitri Grigorievich Plejanov, un conocido maestro de Yaroslavl. Por alguna razón, estos maestros fueron retirados, y otros artistas de Yaroslavl completaron el trabajo en las paredes. En la década de 1800, el nivel inferior de las pinturas murales fue renovado por Semen Stepanovich Zavyazoshnikov. En la década de 1860, se renovó la pintura en el altar, y en la década de 1950, la capa de color en toda la iglesia fue reforzada y lavada por V. Bryusova y A. Rogozin. La pintura consta de 320 escenas narrativas y se ha conservado prácticamente en su totalidad. El esquema de la pintura de la iglesia de la Epifanía se distingue de otros conjuntos de Yaroslavl por la sobriedad de su temática, limitada a tres ciclos principales: evangélico, apostólico y litúrgico. Debido a la falta de tambores de luz, el papel principal en el interior lo juega la bóveda cerrada, dividida en cuatro partes. En cada uno de los triángulos de la bóveda se colocan grandes composiciones de festividades evangélicas. En el sector oriental se representa la Trinidad del Nuevo Testamento. En el centro de la composición, las figuras de Cristo y Savaof en el trono, rodeadas de una gloria blanca. La cruz del Gólgota sirve como centro axial del iconostasio. El esquema piramidal se repite también en la pintura de las otras tres bóvedas, dedicadas a la Resurrección, la Ascensión y la Dormición. El centro de estas escenas es la figura de Cristo en una gloria dorada. En la escena de la Resurrección, Cristo es representado dos veces: en la Resurrección vivificante de la tumba y en la Descenso al infierno. La última escena se destaca por su tono optimista y su audaz solución cromática. Cristo está de pie sobre las vigas del infierno y extiende su mano al Adán resucitado, mientras que el arcángel Miguel arroja a Satanás al infierno. Sobre un fondo negro se destacan claramente los símbolos de la esclavitud del pecado. Las paredes de la iglesia están divididas en 9 niveles, el superior de los cuales comienza en la parte inferior de las bóvedas, creando un efecto visual de altura. Seis niveles contienen frisos narrativos, cuya anchura varía de 1,2 a 2 m. El séptimo nivel de las paredes norte y sur está decorado con un ornamento de hierbas, que se repite en los alféizares. Luego siguen la crónica del constructor del templo y el tradicional zócalo. La pintura de las paredes incluye alrededor de 100 composiciones del ciclo evangélico, dedicadas a la vida y sufrimientos de Cristo. Los temas evangélicos ocupan los seis niveles superiores, y en el séptimo se representan las Pasiones de Cristo. En los alféizares de las ventanas se colocan escenas de predicaciones y martirios de los apóstoles. Los frisos horizontales se extienden sobre los arcos de las ventanas, que están decorados con emblemas tradicionales. En el arco del portal occidental se representa el Deisis, en el arco del norte, el Salvador en el sudario. En los alféizares de los portales se representan ángeles. El esquema iconográfico del altar incluye composiciones como "De ti se alegra" y "He aquí el Cordero". En las paredes, escenas litúrgicas, y en la pared occidental, "Sabiduría de Dios, Sofía". En el ápex del portal central se representa la Eucaristía. En la pared occidental del altar, la Liturgia de Gregorio el Teólogo. En el lado occidental del diaconado, la escena de la Elevación del Evangelio. El iconostasio en estilo barroco ucraniano data de principios del siglo XVIII. Su ornamentación tallada recuerda a racimos de uvas. La parte central está adornada con figuras de ángeles. El nivel inferior del iconostasio fue remodelado a principios del siglo XIX. La mayoría de los íconos para el iconostasio fueron pintados entre 1684 y 1691 por Semen Spiridonovich Jolmogorets y su hermano Vasili. En 1830, 1844 y 1858, el templo fue sometido a remodelaciones. En 1833, la iglesia fue rodeada por una cerca de piedra. En 1930, la iglesia fue cerrada y transferida al Museo Estatal, y en 1999 fue devuelta a la Iglesia Ortodoxa Rusa.