El templo, dedicado al santo príncipe Alejandro Nevski, se encuentra en el lado sur del monasterio. Según datos históricos, el abad hieromonje Gennady recibió la bendición para la construcción de un hospital con una iglesia en honor al príncipe Alejandro Nevski en 1810. La construcción se completó en 1816 y la consagración del templo tuvo lugar en 1817.

El conocido historiador y local S.B. Bakhmustov señala que la iglesia de Alejandro Nevski era parte del complejo y ocupaba una posición subordinada, complementando la catedral Spaso-Preobrazhensky, que se encontraba en el centro del conjunto. El lado sur del complejo comenzaba con una torre o pabellón, al que se unía el ahora perdido cuerpo de celdas. Luego, la línea continuaba con la alargada iglesia de Alejandro Nevski, cuyo cubo y cúpula completaban esta parte del perímetro y armonizaban con las torres de esquina. Los arquitectos pensaron que el templo no debía destacar entre los demás edificios: el monasterio tenía solo dos dominantes en altura, la catedral y el campanario, y los demás edificios debían crear un paisaje espiritual.

En la época soviética, el templo fue casi completamente reconstruido y nivelado con los cuerpos de celdas: se demolieron la cabeza, los frontones triangulares y la cúpula. En el edificio se organizó un club, se cerraron algunas aberturas de ventanas y otras se ampliaron. Se destruyeron frescos, el iconostasio y los íconos. Se demolieron los tabiques que separaban la nave en celdas hospitalarias y que separaban el departamento médico del templo. Solo quedaron huellas de la rustificación en las fachadas y un ábside semicircular.

Los creyentes lograron la devolución de la reliquia en 1992-1993, pero la reconstrucción comenzó solo en 2004. Como resultado de amplios trabajos de restauración, la iglesia de Alejandro Nevski adquirió un aspecto completo. Se restauró la superestructura del templo con una cúpula dorada, el techo y se terminó parcialmente la fachada. Las paredes blancas, que necesitaban pintura, el nuevo suelo, la alta cúpula, las puertas reales, los íconos y los utensilios de la iglesia devolvieron al interior del templo su antiguo esplendor.

El 4 de abril de 2010, en el día de la Resurrección de Cristo, después de la reparación, se reanudaron los servicios en el templo, y en 2011 comenzaron los trabajos para la adición de los cuerpos de sacristanes y novicios que se habían perdido.