El príncipe Andrés fue asesinado en su castillo, y el lugar de su muerte bajo la escalera de la torre de la escalera se ha conservado hasta nuestros días. Quizás, en expiación de este crimen, se fundó un monasterio en Bogoliubovo. Nikolai Voronin sugirió que el monasterio en el territorio del castillo apareció con los sucesores de Andrés a principios del siglo XIII, sin embargo, las primeras referencias sobre la historia de la comunidad son escasas y pertenecen a un tiempo posterior. En las listas académicas de los monasterios de la antigua Rusia no se menciona.

Según el decreto de los reyes Juan y Pedro Alekseevich de 1687, la comunidad se convirtió en un monasterio patriarcal, en 1753, en uno sinodal, y más tarde pasó a estar bajo la administración de los arzobispos de Vladimir, y desde 1882 hasta su cierre fue administrado por los vicarios de la diócesis de Vladimir. Al establecer los estados en 1763, al monasterio se le asignó la tercera clase, en 1872, la segunda, y en 1891, la primera. La enorme catedral en honor a la icono de Bogoliubsk de la Madre de Dios fue construida entre 1855 y 1866 en el "estilo ruso-bizantino" según el proyecto de Konstantin Ton.

En 1921 y 1923, el superior fue el vicario de la diócesis de Vladimir, el obispo Krovrosky Afanasy Sakharov. El 3 de junio de 1923, el monasterio fue cerrado, y el 17 de septiembre del mismo año, el presidium del comité ejecutivo del distrito de Vladimir decidió transferir todos los bienes del antiguo monasterio a los comités ejecutivos del distrito y de la volost. Por resolución del 21 de diciembre y del departamento de tierras de Vladimir del 8 de enero de 1924, el conjunto del antiguo monasterio con sus bienes fue transferido a la administración del departamento de museos.

En 1991, parte de los edificios fue entregada a los monjes encabezados por el schemamonje Nikodim. El 14 de enero de 1997, por decisión de la jerarquía eclesiástica, se trasladaron aquí 60 hermanas del monasterio de Zadon, lo que llevó a la creación de dos monasterios, uno masculino y uno femenino. Comenzó la activa revitalización del monasterio: la catedral de la icono de Bogoliubsk de la Madre de Dios fue completamente enlucida, se instaló calefacción por vapor, se colocaron candelabros, uno central que pesa alrededor de 2 toneladas y nueve pequeños laterales. El suelo fue revestido con granito y mármol, el mármol blanco se utilizó para decorar la solea, el altar, el trono, el altar y el lugar elevado. Se restauraron las pinturas, en 2002 se fabricó un nuevo iconostasio tallado y dorado de tres niveles. Se construyeron edificios de servicio, se plantó un huerto, se restauraron los cuerpos de celdas. Funcionan talleres de costura, pintura de íconos y carpintería. Los alrededores resuenan con las campanas festivas que pesan 1050, 2500 y 8000 kg. Junto a la fuente sagrada, en las murallas del monasterio, se construyeron una capilla y dos piletas, una monástica y otra laica.

Se ha renovado la tradición de la procesión con la icono de Bogoliubsk de la Madre de Dios, establecida en el siglo XVIII en memoria de la maravillosa cesación de la peste por las oraciones ante la imagen. La procesión de Vladimir al monasterio de Santo Bogoliubsk se lleva a cabo anualmente el 1 de julio, en el día de la celebración de la icono de Bogoliubsk de la Madre de Dios.

Con los esfuerzos del monasterio de Santo Bogoliubsk se completó la construcción de la casa en el área de Spas-Kupalishche en el distrito de Sudogod, ubicada en la desembocadura del río Sudogda en el Klyazma. Desde 2001, con la bendición del arzobispo de Vladimir y Suzdal, Evlogy, se erigió un complejo monástico en un lugar vacío con un edificio de celdas y edificios de servicio, se acondicionó una fuente milagrosa, y se completó la restauración de la iglesia de Spaso-Preobrazhensky, donde se reanudaron los servicios religiosos.