Auf das Segnen von Patriarch Nikon begann zwischen 1652 und 1662 der Bau des Männerklosters, der 1665 abgeschlossen wurde. Die Weihe der Kirche fand jedoch erst 1670 aufgrund der gegebenen Umstände statt.

Die ursprünglichen Bauherren und Vorsteher des Klosters waren der Abt Isaak und die Ältesten Joseph, Kornilius und Kyrill.

Im Jahr 1752, in der Nacht vor Ostern, wurde das Ufer vom Fluss Don weggespült, und die Kirche stürzte ins Wasser. Danach wurde das Kloster an die Mündung des Baches verlegt.

1785, auf Initiative des Kosakenhetmans A. I. Ilowaiski, wurde das Ust-Medwedizki Kloster ein Frauenkloster. 40 Mädchen aus der Waisenversammlung wurden unter der Leitung des Diakons Wasilij Michailow dorthin verlegt. Die erste Vorsteherin wurde die Witwe des Kosakenobersten Maria Abramowna Karpowa. Der letzte Vorsteher des Männerklosters war der Abt Pawlin sowie der Ust-Choper Priester Peter Jewtichij.

Im Jahr 1871 wandte sich die Äbtissin Arsenia an den Erzbischof Platon mit der Bitte um Erlaubnis zum Bau einer Kirche zu Ehren der Ikone der Gottesmutter von Kasan und erhielt Zustimmung. Das Projekt der Kirche wurde von Professor Ivan Gornostajev von der Sankt Petersburger Akademie der Künste entwickelt. Der Bau wurde im Sommer 1885 abgeschlossen, und die Weihe fand am 8. September desselben Jahres durch den hochwürdigen Mitrophan statt. Die Kathedrale wurde der Ikone der Gottesmutter von Kasan geweiht, und im Untergeschoss wurde eine Kirche mit einem Altar zu Ehren des heiligen Arsenij des Großen eingerichtet. Am 15. September 1885 wurde eine Kapelle zu Ehren der heiligen Apostel Petrus und Paulus geweiht.

Die im byzantinischen Stil in Form eines Kreuzes erbaute Kirche bietet Platz für 5000 Personen. Die Säulen mit Kapitellen in der Kasaner Kirche sind aus italienischem Marmor gefertigt, der in Sankt Petersburg in der Werkstatt von Barinov bearbeitet wurde.

1928 wurde das Kloster geschlossen, und einige Nonnen wurden Repressionen ausgesetzt. Nach den Erinnerungen der Lehrerin aus Kotowo, Tamara Wladimirowna Poljakowa, gründeten einige Nonnen eine "Gemeinschaft", kauften ein Haus, in dem sie beteten und ihren Lebensunterhalt verdienten. Während des Zweiten Weltkriegs gerieten sie in deutsche Gefangenschaft und wurden in die Region Rostow gebracht. Nach dem Krieg kehrten einige nach Hause zurück.

1992 begann, auf das Segnen des Erzbischofs Herman Timofejew, die Wiederherstellung des Klosters.

Im August 2001 wurde das Kloster erneut ein Frauenkloster.

Am 9. September 2012 fand die große Weihe der Kirche der Gottesmutter von Kasan anlässlich des 360-jährigen Bestehens des Ust-Medwedizki Spaso-Transfiguration Frauenklosters statt. Der obere Tempel wurde eröffnet, dessen Restaurierung über 20 Jahre dauerte.

Die Kirche der Verklärung des Herrn mit 33 Kuppeln wurde durch die Bemühungen der Äbtissin Georgina über einen Zeitraum von 10 Jahren erbaut und 2014 geweiht. Diese Kirche war als Klosterkirche gedacht. Im selben Jahr wurde eine Kapelle zu Ehren des heiligen Seraphim von Sarow erbaut.