Die hölzerne Kirche der Epiphanie des Herrn wurde an der Stelle der früheren Durchbruchstoren des Marktes im 17. Jahrhundert errichtet. Zu Ehren dieser Kirche wurde die neue Siedlung, die entlang der Durchbruchstraße gebaut wurde, als Epiphaniesiedlung bezeichnet.

Im Jahr 1701 wurde neben der Kirche der Epiphanie die Kirche des heiligen Andreas, des Erstberufenen, erbaut.

In den Jahren 1731 und 1756 wurde dank der Kaufleute Ivan Afanasjewitsch Michljajew und Sergej Alexandrowitsch Tschernow eine steinerne Epiphaniekirche und ein Glockenturm mit Zeltdach errichtet. Es ist bekannt, dass die Kirche im Jahr 1741 durch ein Feuer stark beschädigt wurde, nur die Wände blieben erhalten. Möglicherweise begann der Bau der steinernen Kirche nach diesem Vorfall. Der Abschluss des Baus wird auf das Jahr 1756 datiert, als an die Kirche ein Speisesaal angebaut wurde, der ihr Volumen erheblich vergrößerte.

So wurde im 18. Jahrhundert der architektonische Komplex der Epiphaniekirche gebildet, der die Hauptkirche, die Winterkirche des heiligen Andreas auf der Nordseite, einen zweigeschossigen Glockenturm mit Zeltdach an der heutigen Ostrowski-Straße, das Pfarrhaus auf der Westseite und ein weiteres Haus, das zur Bolschaja-Durchbruchstraße führte, wo jetzt das Denkmal für Schalyapin steht, umfasste.

Vor der Revolution war die Gemeinde der Epiphaniekirche eine der größten in Kasan. Zu den Gemeindemitgliedern gehörten nicht nur einfache Bürger, sondern auch Aristokraten und große Unternehmer.

Bis 1917 umfasste der Komplex drei Kirchen: die Hauptkälte-Kirche zu Ehren der Epiphanie des Herrn mit einer Kapelle des heiligen Stephanus, die warme Kirche des heiligen Andreas mit einer Kapelle der heiligen Märtyrer Michael von Tschernigow und Feodor sowie eine kalte Einraumkirche, die 1902 im zweiten Geschoss des neuen Glockenturms zur Erinnerung an die dritte Auffindung des Hauptes Johannes des Täufers eingerichtet wurde.

In der sowjetischen Zeit, von 1920 bis 1935, diente die Epiphaniekirche als städtische Kathedrale. In den 1930er Jahren wurde die Kirche des heiligen Andreas abgerissen, und an ihrer Stelle befand sich der Tiergarten des Kasaner Zoos, bis in den 1950er Jahren ein Wohnhaus des Kasaner Pelzverbands gebaut wurde.

Nach der Schließung der Hauptkirche wurden ihre Räumlichkeiten als Lager genutzt, und im Glockenturm befanden sich Handelsstände und eine optische Werkstatt.

In den 1950er Jahren wurde die Epiphaniekirche als Sporthalle der Kasaner Staatsuniversität genutzt, was zu erheblichen Veränderungen führte: Die Dekoration wurde verputzt und die Kuppeln zerstört.

Im Jahr 1960 erhielt der Glockenturm der Epiphaniekathedrale den Status eines geschützten Denkmals der Architektur von lokaler Bedeutung. 1973 wurde er renoviert.

Im Jahr 1995 wurde die Epiphaniekathedrale in die Liste der Objekte des historischen und kulturellen Erbes von föderaler Bedeutung als Denkmal der Stadtplanung und Architektur aufgenommen.

In den Jahren 1996 und 1997 wurde die Epiphaniekathedrale an die Russisch-Orthodoxe Kirche zurückgegeben, und seitdem finden dort täglich Gottesdienste statt.

Der Glockenturm blieb unter der Verwaltung des Ministeriums für Kultur der Tatarischen Republik und wird als Ausstellungsraum für alt-russische Kunst des Staatlichen Museums für Bildende Kunst der Republik Tatarstan genutzt. Im Jahr 2001 wurde im Glockenturm der Kammer-Szalyapin-Saal eröffnet.