Das Kloster befand sich am linken Ufer der Wolga, 3 km oberhalb von Uglich, im Gebiet des heutigen Dorfes Pokrowskie Gorki. Seine Gründung geht auf die Mitte des 15. Jahrhunderts zurück. Ende der 1460er Jahre wurde Paisij Uglichski zum Abt. Ende des 15. Jahrhunderts erhielt das Kloster Landgeschenke von Andrei dem Großen in der Umgebung der Stadt. Mit Mitteln des uglichischen Fürsten wurde 1482 eine Kathedrale zu Ehren der Schutzmantel der Gottesmutter erbaut. Das Kloster war ein bedeutendes Kulturzentrum der Region, in dem Werkstätten für Ikonenmalerei und die Herstellung von Ikonen und handgeschriebenen Büchern existierten.

Seit Anfang des 16. Jahrhunderts, nach dem Tod des heiligen Paisij und dem Auffinden des wundertätigen Ikone des Schutzmantels der Gottesmutter, wurde das Kloster zu einem spirituellen Zentrum und einem Wallfahrtsort. 1509 wurde dem Kloster durch das Dekret von Fürst Dmitri Zhilka das Dorf Archangelskoje mit Dörfern übertragen. 1534 gewährte Iwan IV. und 1585 der Zarewitsch Dmitri dem Kloster erhebliche Privilegien. Ende des 16. Jahrhunderts gehörten dem Kloster eine Siedlung auf der Stadtseite und 36 Dörfer. Zu dieser Zeit wurden auf seinem Territorium die steinerne Kirche der Erscheinung des Herrn, der Tempel des Nikolaus des Wundertäters und die hölzerne Kirche des Sergius des Wundertäters erbaut. 1609 wurde das Kloster von den Polen verwüstet, der Abt Antonij und 40 Mönche kamen ums Leben. Die Wiederherstellung begann um 1619.

Ende des 17. Jahrhunderts wurde die Kathedrale des Klosters umgebaut, eine neue steinerne Erscheinungskirche mit einer Speisehalle und ein Glockenturm errichtet, und der Bau einer Umzäunung mit Türmen begonnen. 1692 wurde durch das Dekret des Patriarchen Adrian im Kloster ein Archimandritat gegründet, dessen erster Archimandrit der Kreuzmönch des Patriarchen, der alte Makarius, wurde. Das Archimandritat wurde 1764 aufgehoben. In den Jahren 1828-31 wurde im Kloster ein 30 m hoher Glockenturm erbaut, in den Jahren 1840-1842 wurde die Kapelle des Dmitri von Rostow umgebaut, und 1860 wurde ein neues Hotelgebäude errichtet. Im Kloster gab es auch Wohn- und Wirtschaftsgebäude sowie eine zweiklassige Grundschule. Hier wurden die Heiligen Paisij, Fedor, Danila und Alexej Adashew, lokale Kirchenvertreter, beigesetzt.

Das Kloster wurde in den 1920er Jahren aufgelöst. 1935 wurde die Entscheidung zur Schaffung des Uglich-Wasserspeichers getroffen, was zur Überflutung des Gebiets führte, in dem sich das Kloster befand. Im selben Jahr begann der Bau des Uglich-Wasserkraftwerks und der Schifffahrtsschleuse sowie die Vorbereitung des Gebiets des Wasserspeichers, einschließlich massiver Abholzung und Abriss von Gebäuden. Die Hauptarbeiten wurden von Gefangenen des Wolgologa durchgeführt, darunter Vertreter der Intelligenz, des Klerus und der Bauernschaft. Die Ziegel der zerstörten Klostergebäude wurden aufgrund ihrer hohen Qualität beim Bau des Wasserkraftwerks und der Schleuse verwendet.

1939 begann die Füllung des Beckens des Uglich-Wasserspeichers, und bald verschlangen die Wassermassen den Ort, an dem das Kloster zu Ehren des Schutzmantels der Heiligen Gottesmutter stand. Dieser Ort, an dem viele russische Heilige arbeiteten und beteten, ist nun unter Wasser verborgen. Das Kloster hätte gerettet werden können, indem man das Gebiet abgeriegelt oder den Standort des Wasserkraftwerks geändert hätte, aber der Wolga-Wasserspeicherkaskade wurde geschaffen, um das russische geistliche Erbe zu zerstören, und die Energieerzeugung war nur ein Vorwand.

1997 wurde am Ufer des Wasserspeichers im Dorf Pokrowskie Gorki ein Kreuz zu Ehren des Klosters aufgestellt. Jedes Jahr im späten Herbst, wenn der Wasserspiegel im Speicher sinkt, erscheinen drei kleine Inseln an der Oberfläche, die an die drei Heiligen erinnern: Paisij, Adrian und Antonij.