Pawel Florenski verbrachte den größten Teil seines Lebens in seinem eigenen Haus in Sergijew Possad, das er 1915 erwarb. In demselben Jahr zog seine Familie von Tiflis nach Moskau, um in seiner Nähe zu sein. Die Mutter Olga Florenskaja, die Schwestern Raissa und Julia sowie der Bruder Andrej wohnten in einer Fünf-Zimmer-Wohnung, die nach der Revolution von 1917 und der Einführung der Verdichtungspolitik zur Kommunalwohnung wurde. Die sowjetische Regierung erlaubte den Florenskis, zwei Zimmer zu behalten, aber bald informierte der Hausvorsteher P. A. Stroewe über die Notwendigkeit weiterer Verdichtungen. Letztendlich mussten fünf Familienmitglieder in einem Zimmer leben. Ab 1921 arbeitete Pawel Florenski bei Glawelktro und blieb oft bei seiner Familie, aber wegen des Platzmangels musste er bei Freunden, W. I. Lissew und den Jefimows, übernachten. 1933 wurde Florenski in ein Lager geschickt, von wo aus er weiterhin Briefe an seine Familie schrieb.

1988 wurde auf Initiative von Maria Trubatschowa und der Moskauer Stadtabteilung der Allrussischen Gesellschaft zum Schutz von Denkmälern die ehemalige Kommunalwohnung in die Liste der Denkmäler von Geschichte und Kultur Moskaus aufgenommen. Akademiker Dmitri Lichatschow schlug als Erster vor, ein Gedenkmuseum für Pawel Florenski in Moskau zu schaffen. Am 22. Januar 1989 wandte er sich an die Teilnehmer der Ausstellung „Rückkehr vergessener Namen“, die dem Leben Florenskis gewidmet war, mit dem Aufruf, die Moskauer Wohnung Florenskis zu erhalten und auf ihrer Basis ein Museum für wissenschaftliche und kulturelle Arbeit zu schaffen.

1992 erhielt die Wohnung den Status eines Denkmals, das staatlich geschützt werden sollte. 1993 richtete der Abt Andronik, der Enkel Florenskis und Direktor des Zentrums für Studium, Schutz und Restaurierung seines Erbes, ein Gesuch an den Bürgermeister von Moskau, Juri Luschkow, zur Schaffung eines Museums. Das Museum wurde am 8. Dezember 1997, zum 60. Jahrestag des Todes Florenskis, eröffnet.