Nach der Ermordung des Moskauer Generalgouverneurs, Großherzog Sergei Alexandrowitsch, im Jahr 1905, verkaufte seine Witwe, Großherzogin Elisabeth Fjodorowna, einen Teil ihres Schmucks, um ein Kaufmannsgut in der Bolshaya Ordynka zu erwerben. Dort begann sie, die Marfo-Mariinskaya Obdach der Barmherzigkeit zu gründen, die zwei Schwestern gewidmet ist: Marfa, die den Dienst am Nächsten symbolisiert, und Maria, die das geistliche Leben verkörpert. Die Obdach war dazu bestimmt, den Kranken und Armen zu helfen sowie Trost für die Trauernden zu spenden.

Am 22. Mai 1908, am Festtag der Himmelfahrt des Herrn, fand die Grundsteinlegung der Kathedrale im Namen des Schutzes der Heiligen Gottesmutter statt. Die Kirche wurde bis 1912 unter der Leitung des Architekten A. Schussew im Stil der alten russischen Architektur erbaut. Für die Wandmalerei der Kirche lud Elisabeth Fjodorowna die Künstler Michail Nesterow, Pawel Korin und den Bildhauer Sergei Konenkow ein. Nesterow schuf Kompositionen wie „Der Weg zu Christus“ mit 25 Figuren, „Christus bei Marfa und Maria“, „Morgen der Auferstehung“ sowie das unter dem Gewölbe dargestellte Bild Gottes Sabaoth und das Antlitz des Erlösers über dem Portal. In der Kirche wurde eine geheime Treppe eingerichtet, die in die unterirdische Gruft führte, die von Korin zum Thema „Der Weg der Gerechten zum Herrn“ bemalt wurde, wo die Äbtissin sich wünschte, beigesetzt zu werden. An der Fassade der Schutzkirche wurde eine Ansicht von Jerusalem mit der Rotunde des Heiligen Grabes und der Kuppel der Kirche Maria Magdalena dargestellt, zur Erinnerung an den Besuch des Heiligen Landes. Zwölf Glocken der Glockenstube waren auf den „Rostower Klang“ gestimmt. Die kleine Kirche, die für tausend Personen ausgelegt war, sollte auch als Vorlesungssaal dienen. In den 1920er Jahren befand sich im Schutzkathedralen ein Haus für sanitäre Aufklärung und später Restaurierungswerkstätten. Im Krankenhausgebäude mit der Kirche der Heiligen Marfa und Maria befand sich die Ambulanz des Professors F.A. Rein.

Die Wiederbelebung der Obdach begann 1990 mit der Eröffnung des Denkmals für die Großherzogin Elisabeth Fjodorowna, das von V.M. Klykow im Innenhof der Obdach geschaffen wurde. Heute lebt die Obdach ein neues Leben und folgt weiterhin den Zielen, die bereits in der vorrevolutionären Zeit festgelegt wurden.