Das Dorf Zawarsino wurde 1626 gegründet. Dort befand sich eine Kirche, die Johannes dem Täufer gewidmet war, aber nach der Revolution von 1917 wurde das Gebäude geschlossen und in einen Klub umgebaut. In den 80er Jahren des 20. Jahrhunderts wurde es baufällig und abgerissen.

Im Jahr 2004 entstand in der Siedlung wieder eine orthodoxe Gemeinde. Eine Initiative von Bürgern strebte lange den Bau eines Gebetshauses an. 2011 wurde ein Grundstück auf einer Anhöhe im Zentrum der Siedlung ausgewählt, wo die Kirche errichtet wurde.

Am 7. Juli 2014, zum Fest der Geburt des Propheten, Täufers und Vorläufers des Herrn Johannes, feierte der Metropolit von Tomsk und Asino, Rostislav, die Göttliche Liturgie in der Johannes-der-Täufer-Kirche des Dorfes Zawarsino, am Tag des Patroziniums der Kirche.