In den 20er Jahren des 16. Jahrhunderts führte Erzbischof Makariy eine gemeinschaftliche Regelung in den Nowgoroder Klöstern ein, was zum Bau von Speisesälen in mehreren Klöstern führte. 1557 wurde im Geistlichen Kloster auf Bestellung des Abtes Jona ein steinerner Speisesaal mit der Kirche der Heiligen Dreifaltigkeit errichtet.

Ursprünglich hatte die Kirche der Dreifaltigkeit wahrscheinlich eine Kapelle des heiligen Nikolaus, die in der Beschreibung von 1591 erwähnt wird. In den Dokumenten von 1582 und 1686 wurde diese Kapelle fälschlicherweise als separate Kirche bezeichnet, aber wann sie aufgehoben wurde, ist unbekannt. Im Erdgeschoss des Speisesaals befanden sich die Küche, die Brotbackstube und zwei Kühlräume für Kwas, und im zweiten Stock der Speisesaal und die Sakristei. Das Gebäude wurde während der schwedischen Besetzung in den Jahren 1611 und 1617 sowie durch einen Brand im Jahr 1685 stark beschädigt.

Im Jahr 1812 wurde im oberen Stockwerk des Speisesaals eine Kapelle der Tichwiner Ikone der Gottesmutter eingerichtet, und 1821 wurde im nordöstlichen Teil dieses Stockwerks eine Sakristei eingerichtet. Erzbischof Makariy beschrieb 1860, dass an der westlichen Seite des Speisesaals ein alter zweigeschossiger Bau für die Schwestern angrenzt.

Im 19. Jahrhundert, genau wann ist nicht bekannt, wurden der Speisesaal und die Kirche teilweise umgebaut: Der zentrale Pfeiler und die Gewölbe des oberen Stocks wurden abgerissen, über dem Speisesaal wurde eine flache Decke gemacht, und einige Fensteröffnungen wurden verändert. Der Abschluss der Kirche wurde in einen vierseitigen umgebaut. Wahrscheinlich fanden die Arbeiten in den 20er Jahren des 19. Jahrhunderts statt, da 1822 Alexander I. 10.000 Rubel für die Reparatur der Klosterkirchen bereitstellte. 1910 wurde südlich der Kirche der Dreifaltigkeit ein neuer einstöckiger steinerner Speisesaal mit der Kirche des heiligen Wladimir, des heiligen Michael von Twer und der Märtyrerin Natalia erbaut.

Die Kirche der Heiligen Dreifaltigkeit gehört zu den typischen säulenlosen, fünfkuppeligen, dreichörigen Kirchen mit Unterkirche und Keller. Der Keller besteht aus einem rechteckigen Raum, der durch eine spätere Trennwand mit einer Öffnung unterteilt ist. Der Raum ist mit einem Tonnengewölbe mit Auflager versehen. In der westlichen Wand befinden sich zwei steinerne Treppen. Der Hauptkörper der Kirche ist unkonventionell gestaltet: Die Stützboogen auf den Pendentifs tragen die zentrale Trommel mit einem niedrigen sphärischen Gewölbe. Die Fassaden sind mit eleganter Dekoration mit Bögen und Nischen mit spitzem Abschluss geschmückt. Die Kirche ist aus Kalksteinplatten mit einer Ziegelverkleidung auf Kalkmörtel errichtet. Die Abdeckung der Kirche ist schindelgedeckt, die Apsiden und die Kuppeln der Trommeln sind mit Schindeln bedeckt, der Speisesaal hat ein Satteldach.

Die Kirche der Heiligen Dreifaltigkeit ist ein hochkünstlerisches Beispiel aus der Mitte des 16. Jahrhunderts und weist eine Reihe einzigartiger kompositorischer, konstruktiver und dekorativer Merkmale sowie harmonische Proportionen auf. Sie wurde während des Zweiten Weltkriegs stark beschädigt, aber 1963 nach dem Entwurf des Architekten T. V. Gladensko restauriert.