Der Tempel des Propheten Elias ist ein einstöckiges Gebäude von kleiner Größe, das in Form eines Quadrats mit einem halbrunden Altar gestaltet ist. Für den Bau wurde massiver Ziegelstein verwendet. An die Kirche schließen sich zwei zusätzliche Räume an, die früher als Krankenhauszimmer und Speisesaal mit Küche dienten. Diese Gebäude wurden zu unterschiedlichen Zeiten errichtet, was an den Fugen zwischen ihnen sichtbar ist. Zwischen der Kirche und den Zimmern gibt es einen "Hörschacht", der mit einem Metallgitter verschlossen ist, damit die Patienten die Gottesdienste hören und sehen können.

Der nordöstliche Teil des Klostergeländes, wo sich die Krankenhauszimmer und die Iljinskirche befinden, wurde zur Begräbnisstätte der im Kampf 1610 Gefallenen. Die Legende über die Existenz eines Friedhofs an diesem Ort wurde in den Jahren 1955-1960 während des Baus eines Wasserturms und der Verlegung von Wasserleitungen bestätigt. So dient der Tempel des Propheten Elias mit den Krankenhauszimmern, der auf den Überresten der Vorfahren errichtet wurde, als Denkmal für die Helden, die in den Kämpfen für das Vaterland gefallen sind.

Zur Erinnerung an die tragischen Ereignisse des Jahres 1610, als die Polen das Kloster zerstörten und alle seine Verteidiger töteten, wurde neben dem Tempel des Propheten Elias ein steinernes Kreuz aufgestellt. Von diesem Tempel aus begann die neue Geschichte des Klosters Ende des 20. Jahrhunderts. 1991, nach der Übergabe des Pafnutiew-Klosters an das Bistum Kaluga durch die sowjetische Regierung, kehrten die Mönche in die Abtei zurück und begannen mit den ersten Gottesdiensten in diesem Tempel. Am 13. April 1991 fand die Weihe der Iljinskirche mit den Krankenhauszimmern statt, in den Altar wurden die Reliquien des heiligen Charalampos, Bischof von Magnesia, gelegt.