Im Jahr 1779 wurde auf dem Gelände des Schutzmantel-Friedhofs eine hölzerne Kirche auf Anordnung des Generalgouverneurs von Livland, J. J. Braun, erbaut. Zwei Jahre zuvor, im Jahr 1777, gab es eine kleine hölzerne Kapelle, die hinter dem Ragul-Tor an der Stelle eines alten Militärfriedhofs stand. Der Erlass der Pskower Geistlichen Konsistenz Nr. 3985 vom 6. November 1779 ordnete den Bau einer Kirche an, die nach dem Schutzmantel der Heiligen Gottesmutter benannt wurde. Die Kapelle wurde in eine Kirche umgewandelt, und die Ikonen, der Altar und der Ikonostase wurden aus der Feldkirche des Pskower Infanterieregiments, das den Standort bei Riga verlassen hatte, entnommen. Ab dem 4. Dezember 1779 fanden im Tempel Gottesdienste statt, nachdem das Antimens von der Pskower Geistlichen Konsistenz an die Rigasche Geistliche Verwaltung übergeben worden war.

Im Jahr 1869 wurde an der Schutzmantel-Kirche die Petrus- und Paulus-Bruderschaftsschule eröffnet. Im Dezember 1875 zerstörte ein Feuer das hölzerne Gebäude der Schutzmantel-Kirche. Ein Wettbewerb für den Bau einer neuen Kirche wurde ausgeschrieben, und mit Spenden der Gemeindemitglieder wurde eine Kirche nach dem Entwurf von Robert Pflug errichtet. Am 9. September 1879 fand die Weihe der neuen steinernen Schutzmantel-Kirche statt, die von seiner Exzellenz Filaret II. geleitet wurde.

Vor dem Beginn des Ersten Weltkriegs wurde das Innere der Kirche abgebaut und ins Landesinnere des Russischen Reiches evakuiert, um Plünderungen zu vermeiden. Die Sakristei, die Glocken und der Ikonostase wurden abtransportiert. In der Zeit der inneren Konflikte, die die Region erfassten und nach Abgeschiedenheit strebten, war die Kirche nicht in Betrieb und verfiel. Nach dem Ende der Bürgerunruhen und in den ersten Jahren der souveränen Lettischen Republik blieb die Kirche verlassen. Erst 1921, mit der Ankunft von Johannes (Pommer), einem Kämpfer für den orthodoxen Glauben und die russische Kultur, begann ihre Wiederherstellung.