Die Kreuzerhöhungskirche befindet sich im sogenannten "südlichen" Gebäude, das von 1882 bis 1887 erbaut wurde. Es handelt sich um ein zweigeschossiges Gebäude mit einem Kuppelgeschoss im klassizistischen Stil. Im Kuppelgeschoss befand sich die Kirche, während in den ersten beiden Etagen die Klosterkantine, eine Kunstwerkstatt, ein Krankenhaus, eine Sakristei und Zimmer für Waisenkinder untergebracht waren, die im Kloster erzogen wurden. Im Keller befanden sich eine Bäckerei und eine Brauerei.

Die erste Erwähnung der zivilen Nutzung der Kreuzerhöhungskirche datiert auf Januar 1929, als die Gemeinde des Gottesmutterklosters einen Antrag auf Schließung der Hauptsommerkathedrale stellte. Der Abt der Gottesmutterkirche, Priester Alexander Lebedev, informierte das NKWD, dass "die verlassene Kreuzerhöhungskirche bereits für die Bedürfnisse des Staates übergeben wurde". Dieser Fakt wurde nicht dokumentiert, und die Behörden prüften die Angelegenheit dringend. Bereits am 13. Februar 1929 wurde in der Sitzung des Präsidiums des ZK der TASSR beschlossen, den Vertrag zu kündigen, die Kirche als geschlossen zu betrachten und die Räumlichkeiten zur Erweiterung der Schule Nr. 12 zu nutzen. Der NKF wurde beauftragt, das Eigentum der geschlossenen Kirche zu liquidieren. Ende des Monats wurde die Kirche offiziell geschlossen, da sich in ihrem Gebäude bereits seit langem eine Grundschule befand. Am 1. März wurde das Eigentum der Kreuzerhöhungskirche des ehemaligen Kazaner Klosters in den Staatsfonds übergeben, und das Gebäude wurde vom städtischen Kommunalbetrieb erfasst.

Bis heute hat sich die Kreuzerhöhungskirche in veränderter Form erhalten. Lange Zeit wurde das Gebäude vom Pädagogischen Institut genutzt und 2004 an das wiederhergestellte Kazan-Kloster übergeben.

Am 29. Oktober 2007 wurde neben der Kreuzerhöhungskathedrale ein kleiner Glockenturm errichtet. Sieben Glocken, mit einem Gewicht von 6 bis 370 Kilogramm, wurden im Ural-Werk "Pjatkov und Co" aus Glockenbronze gegossen und von Unternehmern aus Jekaterinburg dem wiedererstehenden Kloster geschenkt. Jetzt begleitet das Glockenläuten jeden Gottesdienst in der Kreuzerhöhungskathedrale.

Am 27. April 2013, am Vorabend des Lichtvollen Dienstags, besuchte der Metropolit von Kasan und Tatarstan, Anastasius, das Kazan-Kloster, wo er die Seitenkapelle der Kreuzerhöhungskathedrale zu Ehren des heiligen Märtyrers Ermogens, Patriarchen von ganz Russland, weihte.