Die Kirche wurde 1907 auf einem Hügel, am Anfang der Straßen Kirchenn und Basarnaja, mit den Bemühungen der gesamten Gemeinde errichtet. Als Vorbild diente die Auferstehungskirche aus Schadrinsk, die 1880 erbaut wurde. Die Malerei wurde von Künstlern aus derselben Stadt durchgeführt. Die Kirche, die zu Ehren der Heiligen Dreifaltigkeit benannt wurde, wurde 1908 anlässlich des entsprechenden Feiertags geweiht. Der erste Priester war Vater Witalij Schmotin, und der Diakon, Nikolai Gruntsevski, wurde aus dem Dorf Warlakowo versetzt.

Im November 1936 wurde der Priester der Mischkino-Kirche, Vater Wasilij Nikolajewitsch Polowinkin, sowie das Mitglied des Kirchlichen Rates T.S. Ponomarjow und der Kirchenschreiber A.P. Ankudinov verhaftet, weil sie der antisowjetischen und religiösen Agitation beschuldigt wurden.

Im Mai 1937 fanden in den Betrieben von Mischkino Versammlungen der Arbeitskollektive statt, bei denen die Schließung der Kirche diskutiert wurde. Die Entscheidung zur Schließung wurde einstimmig getroffen. Bald darauf wurde die Kirche geschlossen, die Glocken abgenommen und zur Einschmelzung geschickt, ein Teil des Zauns wurde für Geländer in der Schule verwendet, und im Gebäude wurde ein Lager für Kleie eingerichtet.

Von 1940 bis 1946 befand sich im ehemaligen Kirchengebäude ein Getreidelager des Staatsversicherungsfonds. Der Zweite Weltkrieg änderte die Einstellung zur Kirche, und am Vorabend von 1945 sandten A.A. Antonova, 20 Witwen und zwei alte Männer, die am Bau der Kirche beteiligt waren, ein Schreiben an den Rat der Volkskommissare der UdSSR mit der Bitte, die Kirche in Mischkino wieder zu eröffnen.

Anfang März 1947 wurde das Kirchengebäude den Gläubigen zurückgegeben, und es wurde schnell in Ordnung gebracht. Die Ikonen für den Ikonostase wurden aus den Häusern der Anwohner gebracht. Die Kirche wurde erneut eröffnet und am Vorabend des Feiertags der Heiligen Dreifaltigkeit im Mai 1947 von dem Priester Michail Pawlowitsch Birjukow aus Schadrinsk geweiht. Zu dieser Zeit war Vater Wasilij, Wasilij Wasiljewitsch Gomsikov, der bis 1989 als Pfarrer diente und im Umfriedung der Kirche beigesetzt wurde, der Priester. Seit 1989 wurde Vater Alexej Fasola der Pfarrer, der viel für die Kirche getan hat: Er erwarb Glocken und brachte das Glockenläuten nach Mischkino zurück und erneuerte die Heizungsanlage.