Im 19. und zu Beginn des 20. Jahrhunderts diente Istanbul oft als Halt für Pilger, die nach Athos oder ins Heilige Land unterwegs waren. Zu ihrem Komfort wurde in der Nähe des Hafens ein Konvent gebaut, in dessen sechstem Stock sich ein Tempel befand. 1914 nutzten die türkischen Behörden das russische Konvent als Lager, aber bereits 1918 wurde es wieder eröffnet.

Nach der Oktoberrevolution kamen viele russische Emigranten nach Istanbul, und die Kirche des Heiligen Apostels Andreas wurde für sie zu einem wichtigen Ort. In den Jahren 1928 und 1929 malte der Künstler Nikolai Perow ihre Innenräume aus. Obwohl die Kirche in den 1930er Jahren vorübergehend geschlossen wurde, blieb sie von den 60er bis zu den 90er Jahren des 20. Jahrhunderts die einzige aktive Kirche in Istanbul. Derzeit finden in der Kirche unregelmäßig Gottesdienste statt.