Laut der Erzählung von Nikolai Motowilow, die er von Pater Seraphim selbst hörte, begab sich der Heilige, nachdem er am 25. November 1825 aus der Einsamkeit trat, zur Fernen Wüste. Am theologischen Quell erschien ihm die Gottesmutter mit den Aposteln Petrus und Johannes dem Theologen. Die Gottesmutter schlug mit ihrem Stab auf den Boden, und aus ihm sprudelte eine Quelle mit klarem Wasser. An diesem Ort grub der heilige Seraphim einen Brunnen, und auf sein Gebet versprach die Gottesmutter, die Wasser der Quelle mit heiliger Kraft zu segnen.

Dieses Gespräch fand Ende November 1831 in der "Pazhninka" von Pater Seraphim in der Nähe der Wüste statt, kurz nachdem er Motowilow geheilt hatte. Der Heilige ließ Motowilow die gnädigen Wirkungen des Heiligen Geistes spüren: blendendes Licht, Wärme, himmlischen Duft und Frieden in der Seele. "Dank dem Herrn Gott für seine Gnade", sagte er zu Motowilow, "ihr habt gesehen, dass ich mich nicht gekreuzigt habe, sondern nur im Geiste gebetet habe, und der Herr hat die Bitte des armen Seraphim erfüllt." Am Ende des Gesprächs versprach Pater Seraphim Motowilow, dass der Herr ihm helfen würde, dies im Gedächtnis zu behalten, damit dieses Wissen der ganzen Welt zugänglich werde.

Am Rand des Berges wurde für den Einsiedler eine kleine Hütte ohne Fenster und Türen gebaut, in die man durch das Kriechen unter der Wand gelangen konnte. Die moderne Kirche erinnert an dieses erste Gebäude in der Nähe der Wüste. Zu der Quelle des heiligen Seraphim strömten viele Pilger, und es geschahen wunderbare Heilungen. Hier besuchte die kaiserliche Familie im Jahr 1903, und ein Jahr später wurde der Thronfolger bei der Kaiserin Alexandra Fjodorowna geboren. Im Jahr 1903 wurde über der Quelle eine Kapelle und ein Taufbecken erbaut, aber in der Sowjetzeit wurde alles zerstört und die Quelle betoniert. Der Fluss Sarovka wurde gestaut und es entstand der Teich "Borovoe".

Im Jahr 1991 begannen Mitglieder der historischen Vereinigung "Sarowskaja Pustyn" mit der Suche nach diesem heiligen Ort. Infolge von Ausgrabungen fanden sie den Ort der Kapelle und des Taufbeckens. Das Gebäude ist nicht erhalten geblieben, aber die Fundamente und unteren Räume sind intakt geblieben. In diese Räume führten Stufen, die mit Fliesen ausgelegt waren, und der Boden war mit Fliesen mit schönem Ornament belegt.

Später wurde in der Nähe der Wüste ein Gedenkstein und ein Kreuz aufgestellt, und im Jahr 2003 wurde eine Kapelle gebaut, die dann abgerissen wurde. Im Jahr 2006, zum 300. Jahrestag des Sarower Heiligen-Uspenski-Klosters, begann der Bau der Kirche an diesem historischen Ort. Die Kirche wurde mit einem Altar und einem Eingang errichtet. Das zugeschüttete Taufbecken befindet sich näher am Teich, und das gesamte Gelände wurde der Kirche übergeben und eingezäunt. Die Kirche des Heiligen Geistes wurde 2006 von Patriarch Alexius II. besucht, und am 27. August weihte Erzbischof Georgij sie ein.

In der Kirche befinden sich Ikonen, die in der Werkstatt von Pawel Busalaev mit Mitteln der Seraphim Sarowski Stiftung geschaffen wurden. Bei der Weihe der Kirche im Jahr 2006 wurde die erste Ikone des heiligen Seraphim mit neuen Kleezeichen übergeben. Ein Jahr später wurde die Ikone des heiligen Sergius von Radonesch mit zwei neuen Kleezeichen gebracht. Am 29. Juni 2010 weihte Erzbischof Georgij fünf weitere Ikonen für die Kirche ein, darunter "Der Herr Allmächtige", "Das Gebet um den Kelch" und andere.