Die Kirche der Schutzmantel auf dem Torg wurde anstelle einer älteren Kirche von Joachim und Anna errichtet. Der Bau der Kirche von Joachim und Anna steht im Zusammenhang mit den Besuchen des Zaren Iwan des Schrecklichen in Wologda. Sein erster Besuch der Stadt datiert auf das Jahr 1545. 1549 wurde Iwan eine Tochter namens Anna geboren, und zu Ehren dieses Ereignisses wurde im Neuen Jungfrauenkloster ein Tempel eingeweiht, der Joachim und Anna gewidmet war. Die wologodische Holzkirche von Joachim und Anna wurde in den 1560er Jahren zur Hauskirche des hölzernen Palastes von Iwan dem Schrecklichen. Nach dem Brand von 1605 wurde die Kirche wiederhergestellt und erhielt den Namen von Joachim und Anna beim Fürsten im Flur, und 1627 wurde sie von Joachim und Anna am Alten Fürstenhof genannt. Architektonisch gehörte die Kirche aus der zweiten Hälfte des 17. Jahrhunderts zu den Typen der Zellenkirchen.

Nach dem Brand von 1679 wurde die Kirche mit dem Hauptaltar zu Ehren der Schutzmantel der Heiligen Gottesmutter und dem Seitenaltar von Joachim und Anna wiederhergestellt. Die warme Holzkirche, die wahrscheinlich nach dem Brand von 1698 umgebaut wurde, stand bis in die 1780er Jahre. Der Vorsteher Kirill Pojarkov und die Gemeindemitglieder erhielten die Erlaubnis des Erzbischofs Irinäus zum Bau einer Steinkirche. Es ist bekannt, dass die alte Holzkirche während des Baues ohne Unterbrechung der Gottesdienste versetzt wurde. Nach Abschluss des Baus der Steinkirche wurde die alte abgerissen und zu Brennholz verarbeitet.

Es gibt Erwähnungen der Kirche der Schutzmantel in Wologda Ende des 15. Jahrhunderts, und in den Chroniken wird berichtet, dass sie 1486 verbrannte. Es gibt jedoch keine genauen Daten über die Verbindung dieser Kirche mit der Kirche der Schutzmantel auf dem Torg. Ein indirekter Beweis für den früheren Ursprung der Schutzmantelkirche könnte die Existenz der Schutzmantelstraße zu Beginn des 17. Jahrhunderts sein, wo sich der Fürstenhof und die Kirche von Joachim und Anna befanden.

Die Steinkirche mit dem Hauptaltar zu Ehren der Schutzmantel der Heiligen Gottesmutter und den Seitenaltären von Makarius von Unzha und Joachim und Anna wurde in den Jahren 1778-1780 erbaut. Ab 1832 wurde die Kirche zur Sommerkirche, kalt, und trat der Gemeinde der Schutzmantel-Kasan bei, die nach der Vereinigung mit der Kasaner Kirche auf dem Sumpf gegründet wurde.

In den frühen 1920er Jahren wurde die Kirche geschlossen und dem Gubarchiv übergeben, trotz der strengen Bedingungen, die die sowjetische Macht für Kirchen festgelegt hatte. Die Schließung des Tempels, in dem sich zwei Gemeindegemeinschaften, die Schutzmantel-Kasan und die Nikolai-Sennoplozhskaya, befanden, führte zu starkem Protest der Gemeindemitglieder. Die Gottesdienste wurden 1992 wieder aufgenommen, und 1995 wurde an der Kirche eine Sonntagsschule eröffnet.