Die große fünfkuppelige Kirche wurde 1894-1897 von den Architekten A.F. Meisner und A.A. Nikiforov als Haupttempel des Klinischen Stadtteils der Moskauer Universität auf dem Jungfrauenfeld errichtet. Professor A.M. Makeev, der die Geburtsklinik leitete, wurde zum Stifter der Kirche.

Die Weihe der Kirche markierte den Abschluss des Baus des klinischen Stadtteils. Sie wurde zur Hauskirche für alle Kliniken auf dem Jungfrauenfeld, und ihre Gemeindemitglieder waren Ärzte, Personal, Patienten und Studenten. In der Kirche wurden oft Neugeborene getauft, die in der Geburtsklinik zur Welt kamen.

Die Kirche befindet sich an der Kreuzung der Straßen Pogodinskaja und Jelanskogo und öffnet die Allee des Lebens, die von den Gebäuden des klinischen Stadtteils gebildet wird.

A.M. Makeev, ein tiefgläubiger Mensch, hatte den Plan gefasst, eine Krankenhauskirche zu Ehren des Erzengels Michael, dem Schutzpatron seines Bruders, zu bauen. Neben einer einmaligen Spende für den Bau finanzierte er auch die Ausstattung und den Unterhalt. Während des Baus gab es eine weitere Spende von der Mitarbeiterin der Geburtsklinik E.V. Solowjowa.

Die Kirche war im Besitz der Universität und galt als eine der besten in Moskau.

Im Jahr 1911 wurden die Seitenaltäre des Heiligen Alexander Newski und der Märtyrerin Katharina zu Ehren des Hauptstifters und seiner Schwester hinzugefügt.

Während des Ersten Weltkriegs wurde der klinische Stadtteil zu einem Krankenhaus, und die Priester der Kirche kümmerten sich um viele verwundete Soldaten. Dies dauerte bis zur Revolution von 1917.

Im Jahr 1918 wurde der Tempel zur gewöhnlichen Pfarrkirche, und ihr Eigentum wurde als „Volkseigentum“ erklärt. 1922 wurde das Eigentum beschlagnahmt, einschließlich mehr als einem Pund wertvoller Gegenstände und des Leichentuchs.

Im Jahr 1931 wurde der Tempel geschlossen, um einen Arbeiterclub der Fabrik „Kautschuk“ zu organisieren.

Im Gebäude waren zu verschiedenen Zeiten eine „Kulturaufklärung“, ein Sportplatz, eine Apotheke, ein Lager und ein Institutsmuseum untergebracht. Die Türme und die Glockenstube wurden abgerissen, neue Fenster wurden geschlagen, die Innenausstattung wurde zerstört und Trennwände wurden eingerichtet.

1976 sollte das Gebäude auf Initiative des 1. Moskauer Medizinischen Instituts I.M. Sechenow abgerissen werden. Es wurde von dem bekannten Restaurator P.D. Baranowski gerettet, aber ein Drittel der Kirche war zu diesem Zeitpunkt bereits zerstört. Die halbzerstörte Kirche stand bis in die 1990er Jahre, als Mittel für ihre Wiederherstellung gefunden wurden.

Auf Initiative des Rektors der Medizinischen Akademie M.A. Palzewa wurden beide Gebäude der ehemaligen klinischen Kirchen der Russisch-Orthodoxen Kirche übergeben.

Die große Weihe der Kirche fand am 19. September 2002, am Tag des Gedächtnisses des Wunders des Erzengels Michael in Chone, statt. Die Weihe wurde von Patriarch Alexius II. von Moskau und ganz Russland durchgeführt.

Das Kirchenikone des Erzengels Michael, geschmückt mit Kreuzchen, wurde aus der Kirche des Heiligen Nikolaus des Wundertäters in Chamowniki gebracht. In der Kirche werden auch seltene Ikonen aufbewahrt: das Bild der Gottesmutter „Helferin bei der Geburt“, „Heilerin“ und die Ikone der großen Märtyrerin Katharina, der Schutzpatronin der Kinder und Helferin bei der Geburt. Hier befinden sich auch Teile der Reliquien der großen Märtyrer Pantaleon und Theodor Tiron.