Die Geschichte der Kirche des heiligen Märtyrers Antipia auf dem Kolymashny-Hof beginnt im 16. Jahrhundert. Die steinerne Kirche wurde um 1530 in der Konjushennaya-Siedlung errichtet. Der Name der Kirche ist mit ihrer Lage verbunden: „bei den großen Ställen“, „was in Tschertolje“, „was bei den staatlichen großen Ställen“.

Die Kirche Antipia ist bemerkenswert durch das Vorhandensein von zwei Altären: einem im Namen des heiligen Märtyrers Antipia und einem kleinen Altar im Namen des heiligen Gregor von Dekapolis. Der Legende nach wurde der kleine Altar von Grigori Lukyanovich Belsky, bekannt als Maljuta Skuratov, erbaut, dessen Hof sich in der Nähe befand.

Der heilige Antipia ist bekannt als Heiler, der bei Zahnschmerzen hilft. Dies ist die einzige Kirche in Moskau, die Antipia gewidmet ist, und sie zog viele Moskauer an, die unter Zahnschmerzen litten. Hierher kamen Menschen aus verschiedenen Ständen und Teilen der Stadt, um zu beten. Zu den Gemeindemitgliedern gehörten die Lopuchins, die Apraxins, die Obolenskys, und zu Beginn des 20. Jahrhunderts der Künstler Valentin Serov, der in der Nähe lebte.

Im 18. Jahrhundert wurden dem Tempel die Kapellen des heiligen Nikolaus von Myra (1722), der heiligen Katharina (1773) und der Geburt des Johannes des Täufers (1798) hinzugefügt.

1912 wurde gegenüber der Kirche das Museum der Schönen Künste des Kaisers Alexander III. eröffnet, und seitdem sind die Schicksale des Museums und der Kirche eng miteinander verwoben.

Nach der Revolution wurde die Kirche 1929 geschlossen, und das Gebäude wurde den Zentralen Kunstkursen der Vereinigung der Künstler der Revolution übergeben. Es wurde lange Zeit als Wohnheim genutzt, und später wurden dort Restaurierungswerkstätten und das Lager des Puschkin-Museums untergebracht.

In der Sowjetzeit wurde das Gebäude nicht renoviert und befand sich in einem schlechten Zustand. In den 1950er Jahren wurden die Kuppel und der Kopf der südlichen Kapelle des heiligen Nikolaus zerstört.

In den 1960er Jahren begann die Restaurierung der Kirche unter der Leitung des Architekten L.A. David. Es war geplant, alle Teile, die im 17.-19. Jahrhundert entstanden waren, abzureißen, aber das Puschkin-Museum, das das Gebäude gemietet hatte, widersprach dem.

In den 1990er Jahren wurde eine weitere Restaurierung begonnen. 1991 wurde eine Kirchengemeinde gegründet, aber erst 2005 gelang es, die Kirche an die Russisch-Orthodoxe Kirche zu übergeben.