В октябре 1990 года в Куженерском райкоме КПСС прошло совещание, посвященное открытию районного музея. Директором музея был назначен Владислав Васильевич Попов, который начал собирать материалы еще в период работы инструктором райкома. Он посещал деревни, собирая экспонаты, а школы и райком партии помогали, предоставляя свои материалы и библиотеку.

7 ноября 1990 года в здании бывшей трапезной Свято-Никольского женского монастыря была открыта первая экспозиция музея. Согласно приказу Министерства культуры от 21 января 1991 года, музей стал филиалом республиканского музея имени Евсеева. В январе 1997 года, по приказу Министерства культуры и по делам национальностей, музей перешел под управление Куженерского отдела культуры, и его фонд насчитывал 1259 единиц хранения.

21 октября 2007 года, согласно постановлению главы администрации Куженерского района, было создано муниципальное учреждение культуры «Куженерский районный музейно-выставочный центр», и музей получил статус юридического лица. За годы работы музей пополнился новыми экспонатами, проводит экскурсии, мастер-классы, музейные уроки, выставки и праздники.

В музее представлены несколько экспозиций: этнографическая экспозиция «Крестьянский быт конца XIX, начала XX века» с крестьянской избой и коллекцией предметов домашнего обихода и национальных костюмов; экспозиция «Бесценная россыпь эпох» с орудиями труда и фрагментами керамики каменного и железного веков; макет Куженерского монастырского комплекса; экспозиция «Я эту землю родиной зову», рассказывающая об истории и современной жизни поселка Куженер и района; Зал Славы, посвященный важным историческим событиям, таким как Великая Отечественная война, участие советских войск в Афганистане и Чеченская война, а также трагедия на Чернобыльской АЭС и судьбы жителей района; рабочий кабинет В.М. Регеж-Горохова, где представлены его личные вещи и награды.

Ежемесячно в одном из залов музея открываются новые выставки. Основу музея составляют его фонды, в которых на данный момент числится 2000 единиц в основном фонде и 4325 в научно-вспомогательном. В 2019 году в музее был проведен косметический ремонт и обновлены экспозиции.