Музей был основан на основании распоряжения Главы города № 558 от 11 мая 2001 года. Официальное открытие состоялось 7 июля 2001 года, и с этого момента в городе начал функционировать этнографический музей «Эхо Югры», где собираются, обрабатываются и хранятся исторические материалы о коренном народе ханты.

Музейно-выставочный центр находится на третьем этаже культурного комплекса «Библиотека. Краеведческий музей». В выставочном зале № 1 проходят сменные тематические выставки, в том числе с экспонатами из других музеев. В зале № 2 представлена постоянная экспозиция «От истоков к современности», состоящая из трех разделов. Первый раздел посвящен флоре и фауне Югры. Второй раздел знакомит с культурой народа ханты. Третий раздел охватывает период промышленного освоения севера и развитие города.

В центре имеются оборудованные фондохранилища для хранения музейных предметов и коллекций. Фонд музея насчитывает 3 887 единиц хранения.

В 2018 году произошло объединение Краеведческого экомузея и Централизованной библиотечной системы города, в результате чего было создано Муниципальное автономное учреждение культуры «Культурный центр: библиотека-музей». Краеведческий экомузей включает в себя два объекта: Этнографический музей и Музейно-выставочный центр.

На 1 января 2021 года музейный фонд насчитывал более 4 тысяч единиц хранения. Коллекции охватывают различные направления: этнографические предметы, изделия прикладного искусства, исторические технические артефакты, документы, естественно-научные коллекции, живопись, скульптуру, нумизматику и другие.

Краеведческий экомузей представляет собой уникальный уголок природы и культуры. Для жителей и гостей города организуются познавательные экскурсии и культурный отдых.