Колокольня строилась с 1789 по 1799 год. На втором ярусе располагалась церковь святителя Николая, освященная в 1806 году. В 2013 году Николаевская церковь была восстановлена и освящена, а в 2014 году завершилось полное восстановление колокольни.

После закрытия монастыря все колокола сняли, и до сих пор неизвестно, где находится большой колокол. По одной из версий, он затоплен на дне реки Сатис. На колокольне установили часы-куранты, изготовленные мастером Кобылиным из Тулы. Они играли мелодию «Кто избежит тебя, смертный час?», а минутный колокол напоминал о быстротечности жизни. Старинный механизм не сохранился, и долгое время на колокольне были просто часы без боя, работающие от механизма 1961 года. В советское и постсоветское время колокольня использовалась как телетрансляционная башня. Только в 2012 году с нее сняли технические площадки и оборудование, установив новый купол.

В декабре 2013 года была освящена восстановленная надвратная церковь Николая Чудотворца 1806 года, где богослужение возглавил митрополит Нижегородский и Арзамасский Георгий. Храм был полностью обновлен: убрали чужеродные конструкции, заменили инженерные сети и оконные блоки, провели капитальный ремонт. Церковь не только отреставрировали, но и заново расписали в академическом стиле, как в Зосимо-Савватиевском храме.

В 2014 году в ходе восстановительных работ открыли Святые врата и обнаружили сохранившуюся роспись. В советское время там был фальшпотолок, а арки застеклены как окна. После удаления лишнего открылся свод с росписью монастырского времени, орнаментами и христианскими символами. По бокам, над дверными проемами, сохранились остатки сюжетной росписи, пострадавшей от балок перекрытий, но большая часть уцелела.

В апреле того же года на колокольню подняли колокола для восстановленных курантов, и горожане снова услышали мелодичный бой часов. К августу 2014 года колокольня полностью обрела исторический вид.